Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NefhP19246 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NefhP19246 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NefhP19246 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NefhP19246 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NefhP19246 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NefhP19246 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NefhP19246 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NefhP19246 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NefhP19246 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NefhP19246 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NefhP19246 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NefhP19246 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NefhP19246 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NefhP19246 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NefhP19246 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NefhP19246 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NefhP19246 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NefhP19246 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NefhP19246 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NefhP19246 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NefhP19246 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NefhP19246 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NefhP19246 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NefhP19246 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NefhP19246 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NefhP19246 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NefhP19246 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NefhP19246 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NefhP19246 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NefhP19246 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NefhP19246 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NefhP19246 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NefhP19246 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NefhP19246 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NefhP19246 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NefhP19246 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NefhP19246 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NefhP19246 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NefhP19246 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NefhP19246 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NefhP19246 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NefhP19246 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NefhP19246 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NefhP19246 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NefhP19246 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NefhP19246 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NefhP19246 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NefhP19246 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NefhP19246 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NefhP19246 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NefhP19246 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NefhP19246 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NefhP19246 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NefhP19246 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NefhP19246 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NefhP19246 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NefhP19246 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NefhP19246 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NefhP19246 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
NefhP19246 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NefhP19246 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NefhP19246 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NefhP19246 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NefhP19246 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NefhP19246 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NefhP19246 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NefhP19246 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NefhP19246 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
NefhP19246 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NefhP19246 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NefhP19246 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NefhP19246 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NefhP19246 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NefhP19246 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NefhP19246 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NefhP19246 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NefhP19246 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NefhP19246 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NefhP19246 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NefhP19246 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NefhP19246 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NefhP19246 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NefhP19246 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NefhP19246 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NefhP19246 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NefhP19246 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NefhP19246 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NefhP19246 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NefhP19246 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NefhP19246 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
NefhP19246 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
NefhP19246 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NefhP19246 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NefhP19246 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NefhP19246 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NefhP19246 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NefhP19246 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NefhP19246 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NefhP19246 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms