Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sptan1P16546 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sptan1P16546 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sptan1P16546 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sptan1P16546 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Sptan1P16546 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sptan1P16546 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sptan1P16546 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Sptan1P16546 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sptan1P16546 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sptan1P16546 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sptan1P16546 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sptan1P16546 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sptan1P16546 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sptan1P16546 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sptan1P16546 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sptan1P16546 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sptan1P16546 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sptan1P16546 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Sptan1P16546 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Sptan1P16546 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sptan1P16546 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sptan1P16546 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sptan1P16546 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sptan1P16546 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sptan1P16546 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sptan1P16546 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sptan1P16546 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sptan1P16546 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sptan1P16546 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sptan1P16546 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sptan1P16546 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sptan1P16546 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sptan1P16546 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Sptan1P16546 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sptan1P16546 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sptan1P16546 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sptan1P16546 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sptan1P16546 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sptan1P16546 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sptan1P16546 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sptan1P16546 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sptan1P16546 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Sptan1P16546 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sptan1P16546 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sptan1P16546 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sptan1P16546 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sptan1P16546 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sptan1P16546 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sptan1P16546 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sptan1P16546 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sptan1P16546 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sptan1P16546 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sptan1P16546 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sptan1P16546 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sptan1P16546 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sptan1P16546 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sptan1P16546 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sptan1P16546 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sptan1P16546 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sptan1P16546 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sptan1P16546 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sptan1P16546 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sptan1P16546 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sptan1P16546 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sptan1P16546 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sptan1P16546 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sptan1P16546 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sptan1P16546 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sptan1P16546 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sptan1P16546 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sptan1P16546 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Sptan1P16546 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sptan1P16546 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sptan1P16546 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sptan1P16546 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sptan1P16546 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sptan1P16546 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sptan1P16546 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sptan1P16546 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sptan1P16546 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sptan1P16546 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sptan1P16546 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sptan1P16546 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sptan1P16546 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sptan1P16546 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sptan1P16546 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sptan1P16546 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sptan1P16546 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sptan1P16546 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sptan1P16546 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sptan1P16546 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sptan1P16546 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sptan1P16546 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sptan1P16546 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sptan1P16546 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sptan1P16546 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Sptan1P16546 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sptan1P16546 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sptan1P16546 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms