Protein–RNA interactions for Protein: P16054

Prkce, Protein kinase C epsilon type, mousemouse

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Length 737 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkceP16054 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PrkceP16054 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PrkceP16054 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PrkceP16054 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PrkceP16054 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PrkceP16054 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PrkceP16054 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PrkceP16054 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PrkceP16054 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PrkceP16054 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PrkceP16054 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PrkceP16054 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PrkceP16054 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PrkceP16054 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PrkceP16054 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PrkceP16054 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PrkceP16054 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PrkceP16054 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PrkceP16054 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PrkceP16054 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PrkceP16054 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PrkceP16054 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PrkceP16054 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PrkceP16054 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PrkceP16054 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PrkceP16054 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PrkceP16054 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PrkceP16054 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PrkceP16054 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PrkceP16054 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PrkceP16054 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PrkceP16054 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PrkceP16054 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PrkceP16054 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PrkceP16054 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PrkceP16054 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PrkceP16054 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PrkceP16054 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PrkceP16054 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PrkceP16054 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PrkceP16054 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PrkceP16054 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PrkceP16054 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PrkceP16054 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PrkceP16054 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PrkceP16054 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PrkceP16054 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PrkceP16054 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PrkceP16054 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PrkceP16054 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PrkceP16054 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PrkceP16054 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PrkceP16054 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PrkceP16054 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PrkceP16054 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PrkceP16054 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PrkceP16054 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PrkceP16054 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PrkceP16054 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PrkceP16054 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PrkceP16054 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PrkceP16054 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PrkceP16054 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PrkceP16054 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PrkceP16054 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PrkceP16054 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PrkceP16054 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PrkceP16054 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PrkceP16054 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PrkceP16054 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PrkceP16054 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PrkceP16054 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PrkceP16054 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PrkceP16054 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PrkceP16054 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PrkceP16054 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PrkceP16054 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PrkceP16054 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PrkceP16054 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PrkceP16054 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PrkceP16054 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PrkceP16054 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PrkceP16054 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PrkceP16054 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PrkceP16054 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PrkceP16054 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PrkceP16054 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PrkceP16054 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PrkceP16054 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PrkceP16054 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PrkceP16054 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PrkceP16054 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PrkceP16054 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PrkceP16054 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PrkceP16054 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PrkceP16054 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PrkceP16054 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PrkceP16054 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PrkceP16054 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PrkceP16054 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
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