Protein–RNA interactions for Protein: P15530

Cd79b, B-cell antigen receptor complex-associated protein beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd79bP15530 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd79bP15530 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd79bP15530 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd79bP15530 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd79bP15530 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd79bP15530 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd79bP15530 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd79bP15530 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd79bP15530 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd79bP15530 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd79bP15530 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd79bP15530 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd79bP15530 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd79bP15530 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd79bP15530 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd79bP15530 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd79bP15530 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd79bP15530 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd79bP15530 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd79bP15530 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd79bP15530 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd79bP15530 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd79bP15530 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd79bP15530 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd79bP15530 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd79bP15530 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd79bP15530 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd79bP15530 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd79bP15530 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd79bP15530 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd79bP15530 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd79bP15530 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd79bP15530 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd79bP15530 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd79bP15530 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd79bP15530 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd79bP15530 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd79bP15530 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd79bP15530 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd79bP15530 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd79bP15530 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd79bP15530 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd79bP15530 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd79bP15530 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd79bP15530 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd79bP15530 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd79bP15530 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd79bP15530 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd79bP15530 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd79bP15530 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd79bP15530 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd79bP15530 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd79bP15530 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd79bP15530 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd79bP15530 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd79bP15530 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd79bP15530 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd79bP15530 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd79bP15530 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd79bP15530 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd79bP15530 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd79bP15530 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd79bP15530 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd79bP15530 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd79bP15530 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd79bP15530 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd79bP15530 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd79bP15530 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd79bP15530 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd79bP15530 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd79bP15530 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd79bP15530 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd79bP15530 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd79bP15530 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd79bP15530 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd79bP15530 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd79bP15530 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd79bP15530 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd79bP15530 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd79bP15530 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd79bP15530 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd79bP15530 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd79bP15530 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd79bP15530 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd79bP15530 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd79bP15530 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd79bP15530 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd79bP15530 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd79bP15530 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd79bP15530 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd79bP15530 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd79bP15530 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd79bP15530 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd79bP15530 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd79bP15530 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd79bP15530 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd79bP15530 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd79bP15530 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd79bP15530 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd79bP15530 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms