Protein–RNA interactions for Protein: P02716

Chrnd, Acetylcholine receptor subunit delta, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChrndP02716 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ChrndP02716 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ChrndP02716 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ChrndP02716 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ChrndP02716 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ChrndP02716 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ChrndP02716 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ChrndP02716 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ChrndP02716 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ChrndP02716 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ChrndP02716 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ChrndP02716 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ChrndP02716 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ChrndP02716 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ChrndP02716 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ChrndP02716 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ChrndP02716 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ChrndP02716 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ChrndP02716 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ChrndP02716 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ChrndP02716 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ChrndP02716 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ChrndP02716 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ChrndP02716 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ChrndP02716 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ChrndP02716 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ChrndP02716 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ChrndP02716 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ChrndP02716 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ChrndP02716 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ChrndP02716 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ChrndP02716 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ChrndP02716 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ChrndP02716 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ChrndP02716 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ChrndP02716 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ChrndP02716 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ChrndP02716 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ChrndP02716 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ChrndP02716 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ChrndP02716 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ChrndP02716 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ChrndP02716 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ChrndP02716 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ChrndP02716 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ChrndP02716 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ChrndP02716 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ChrndP02716 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ChrndP02716 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ChrndP02716 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ChrndP02716 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ChrndP02716 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ChrndP02716 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ChrndP02716 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ChrndP02716 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ChrndP02716 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ChrndP02716 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ChrndP02716 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ChrndP02716 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ChrndP02716 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ChrndP02716 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ChrndP02716 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ChrndP02716 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ChrndP02716 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ChrndP02716 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ChrndP02716 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ChrndP02716 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ChrndP02716 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ChrndP02716 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ChrndP02716 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ChrndP02716 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ChrndP02716 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ChrndP02716 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ChrndP02716 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ChrndP02716 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ChrndP02716 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ChrndP02716 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ChrndP02716 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ChrndP02716 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ChrndP02716 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ChrndP02716 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ChrndP02716 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ChrndP02716 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ChrndP02716 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ChrndP02716 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ChrndP02716 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ChrndP02716 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ChrndP02716 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ChrndP02716 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ChrndP02716 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ChrndP02716 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ChrndP02716 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ChrndP02716 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ChrndP02716 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ChrndP02716 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ChrndP02716 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ChrndP02716 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ChrndP02716 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ChrndP02716 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ChrndP02716 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms