Protein–RNA interactions for Protein: P01921

H2-Ab1, H-2 class II histocompatibility antigen, A-D beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Ab1P01921 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2-Ab1P01921 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2-Ab1P01921 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2-Ab1P01921 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2-Ab1P01921 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
H2-Ab1P01921 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2-Ab1P01921 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2-Ab1P01921 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
H2-Ab1P01921 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2-Ab1P01921 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2-Ab1P01921 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2-Ab1P01921 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2-Ab1P01921 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2-Ab1P01921 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2-Ab1P01921 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2-Ab1P01921 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2-Ab1P01921 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2-Ab1P01921 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2-Ab1P01921 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2-Ab1P01921 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2-Ab1P01921 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2-Ab1P01921 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2-Ab1P01921 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2-Ab1P01921 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2-Ab1P01921 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2-Ab1P01921 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2-Ab1P01921 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2-Ab1P01921 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2-Ab1P01921 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2-Ab1P01921 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2-Ab1P01921 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2-Ab1P01921 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2-Ab1P01921 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2-Ab1P01921 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2-Ab1P01921 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2-Ab1P01921 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2-Ab1P01921 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2-Ab1P01921 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2-Ab1P01921 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2-Ab1P01921 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2-Ab1P01921 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2-Ab1P01921 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2-Ab1P01921 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2-Ab1P01921 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2-Ab1P01921 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2-Ab1P01921 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2-Ab1P01921 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2-Ab1P01921 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2-Ab1P01921 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2-Ab1P01921 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2-Ab1P01921 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
H2-Ab1P01921 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2-Ab1P01921 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2-Ab1P01921 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
H2-Ab1P01921 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
H2-Ab1P01921 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
H2-Ab1P01921 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
H2-Ab1P01921 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
H2-Ab1P01921 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
H2-Ab1P01921 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
H2-Ab1P01921 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
H2-Ab1P01921 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
H2-Ab1P01921 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
H2-Ab1P01921 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
H2-Ab1P01921 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
H2-Ab1P01921 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
H2-Ab1P01921 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
H2-Ab1P01921 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
H2-Ab1P01921 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
H2-Ab1P01921 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
H2-Ab1P01921 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
H2-Ab1P01921 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
H2-Ab1P01921 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
H2-Ab1P01921 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2-Ab1P01921 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2-Ab1P01921 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2-Ab1P01921 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2-Ab1P01921 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2-Ab1P01921 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2-Ab1P01921 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2-Ab1P01921 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2-Ab1P01921 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2-Ab1P01921 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2-Ab1P01921 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2-Ab1P01921 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2-Ab1P01921 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2-Ab1P01921 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2-Ab1P01921 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2-Ab1P01921 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2-Ab1P01921 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2-Ab1P01921 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2-Ab1P01921 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
H2-Ab1P01921 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2-Ab1P01921 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2-Ab1P01921 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2-Ab1P01921 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2-Ab1P01921 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2-Ab1P01921 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2-Ab1P01921 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2-Ab1P01921 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms