Protein–RNA interactions for Protein: P01820

Ig heavy chain V region PJ14, mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01820 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01820 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01820 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01820 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01820 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01820 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01820 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01820 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01820 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01820 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01820 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01820 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01820 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01820 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01820 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01820 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01820 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01820 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01820 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01820 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01820 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01820 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01820 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01820 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01820 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01820 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01820 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01820 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01820 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01820 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
P01820 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01820 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01820 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01820 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01820 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01820 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01820 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01820 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01820 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01820 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01820 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01820 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01820 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01820 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01820 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01820 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
P01820 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01820 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01820 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01820 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01820 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01820 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01820 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01820 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01820 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01820 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01820 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01820 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01820 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01820 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01820 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01820 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01820 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01820 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01820 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01820 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01820 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01820 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01820 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01820 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01820 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01820 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01820 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01820 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01820 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01820 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01820 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
P01820 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01820 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
P01820 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01820 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
P01820 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
P01820 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01820 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01820 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01820 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01820 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01820 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01820 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01820 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01820 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01820 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01820 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01820 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
P01820 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01820 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01820 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01820 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01820 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01820 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms