Protein–RNA interactions for Protein: P01649

Ig kappa chain V-V regions, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01649 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01649 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01649 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01649 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01649 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01649 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
P01649 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01649 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01649 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01649 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01649 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01649 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01649 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01649 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01649 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01649 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01649 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01649 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01649 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01649 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01649 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01649 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
P01649 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01649 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01649 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01649 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01649 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01649 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01649 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01649 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01649 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01649 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01649 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01649 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01649 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
P01649 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01649 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01649 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01649 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01649 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01649 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01649 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
P01649 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
P01649 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
P01649 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
P01649 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
P01649 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
P01649 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
P01649 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01649 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01649 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01649 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01649 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01649 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
P01649 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01649 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01649 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01649 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01649 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01649 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01649 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01649 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01649 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01649 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01649 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01649 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01649 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01649 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01649 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01649 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01649 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01649 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01649 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01649 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01649 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01649 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01649 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01649 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01649 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01649 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01649 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01649 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01649 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01649 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01649 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01649 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01649 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01649 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01649 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01649 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01649 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01649 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01649 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01649 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01649 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01649 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01649 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01649 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01649 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01649 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms