Protein–RNA interactions for Protein: O88466

Znf106, Zinc finger protein 106, mousemouse

Predictions only

Length 1,888 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf106O88466 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Znf106O88466 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Znf106O88466 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Znf106O88466 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Znf106O88466 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Znf106O88466 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Znf106O88466 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Znf106O88466 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Znf106O88466 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Znf106O88466 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Znf106O88466 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Znf106O88466 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Znf106O88466 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Znf106O88466 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Znf106O88466 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Znf106O88466 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Znf106O88466 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Znf106O88466 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Znf106O88466 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Znf106O88466 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Znf106O88466 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Znf106O88466 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Znf106O88466 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Znf106O88466 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Znf106O88466 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Znf106O88466 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Znf106O88466 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Znf106O88466 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Znf106O88466 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Znf106O88466 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Znf106O88466 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Znf106O88466 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Znf106O88466 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Znf106O88466 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Znf106O88466 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Znf106O88466 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Znf106O88466 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Znf106O88466 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Znf106O88466 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Znf106O88466 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Znf106O88466 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Znf106O88466 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Znf106O88466 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Znf106O88466 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Znf106O88466 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Znf106O88466 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Znf106O88466 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Znf106O88466 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Znf106O88466 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Znf106O88466 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Znf106O88466 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Znf106O88466 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Znf106O88466 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Znf106O88466 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Znf106O88466 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Znf106O88466 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Znf106O88466 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Znf106O88466 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Znf106O88466 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Znf106O88466 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Znf106O88466 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Znf106O88466 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Znf106O88466 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Znf106O88466 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Znf106O88466 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Znf106O88466 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Znf106O88466 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Znf106O88466 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Znf106O88466 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Znf106O88466 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Znf106O88466 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Znf106O88466 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Znf106O88466 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Znf106O88466 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Znf106O88466 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Znf106O88466 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Znf106O88466 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Znf106O88466 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Znf106O88466 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Znf106O88466 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Znf106O88466 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Znf106O88466 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Znf106O88466 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Znf106O88466 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Znf106O88466 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Znf106O88466 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Znf106O88466 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Znf106O88466 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Znf106O88466 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Znf106O88466 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Znf106O88466 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Znf106O88466 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Znf106O88466 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Znf106O88466 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Znf106O88466 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Znf106O88466 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Znf106O88466 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Znf106O88466 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Znf106O88466 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Znf106O88466 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 150.2 ms