Protein–RNA interactions for Protein: O88271

Cfdp1, Craniofacial development protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfdp1O88271 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cfdp1O88271 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cfdp1O88271 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cfdp1O88271 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cfdp1O88271 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cfdp1O88271 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cfdp1O88271 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cfdp1O88271 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cfdp1O88271 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cfdp1O88271 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cfdp1O88271 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Cfdp1O88271 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cfdp1O88271 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cfdp1O88271 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cfdp1O88271 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cfdp1O88271 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cfdp1O88271 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cfdp1O88271 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cfdp1O88271 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cfdp1O88271 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cfdp1O88271 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cfdp1O88271 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cfdp1O88271 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cfdp1O88271 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cfdp1O88271 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cfdp1O88271 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cfdp1O88271 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cfdp1O88271 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cfdp1O88271 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cfdp1O88271 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cfdp1O88271 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cfdp1O88271 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cfdp1O88271 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cfdp1O88271 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cfdp1O88271 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cfdp1O88271 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cfdp1O88271 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cfdp1O88271 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Cfdp1O88271 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cfdp1O88271 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cfdp1O88271 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cfdp1O88271 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cfdp1O88271 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Cfdp1O88271 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Cfdp1O88271 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cfdp1O88271 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cfdp1O88271 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cfdp1O88271 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cfdp1O88271 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cfdp1O88271 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cfdp1O88271 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cfdp1O88271 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cfdp1O88271 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cfdp1O88271 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Cfdp1O88271 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cfdp1O88271 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cfdp1O88271 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cfdp1O88271 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cfdp1O88271 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cfdp1O88271 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cfdp1O88271 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cfdp1O88271 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cfdp1O88271 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cfdp1O88271 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cfdp1O88271 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cfdp1O88271 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cfdp1O88271 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cfdp1O88271 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cfdp1O88271 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cfdp1O88271 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cfdp1O88271 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cfdp1O88271 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cfdp1O88271 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cfdp1O88271 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cfdp1O88271 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cfdp1O88271 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cfdp1O88271 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cfdp1O88271 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cfdp1O88271 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cfdp1O88271 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Cfdp1O88271 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cfdp1O88271 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cfdp1O88271 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cfdp1O88271 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cfdp1O88271 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cfdp1O88271 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cfdp1O88271 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cfdp1O88271 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cfdp1O88271 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cfdp1O88271 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cfdp1O88271 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cfdp1O88271 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cfdp1O88271 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cfdp1O88271 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cfdp1O88271 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cfdp1O88271 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cfdp1O88271 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cfdp1O88271 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cfdp1O88271 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cfdp1O88271 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms