Protein–RNA interactions for Protein: O70456

Sfn, 14-3-3 protein sigma, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SfnO70456 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SfnO70456 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SfnO70456 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SfnO70456 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SfnO70456 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SfnO70456 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SfnO70456 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SfnO70456 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SfnO70456 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SfnO70456 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SfnO70456 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SfnO70456 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SfnO70456 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SfnO70456 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SfnO70456 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SfnO70456 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SfnO70456 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SfnO70456 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SfnO70456 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SfnO70456 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SfnO70456 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SfnO70456 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SfnO70456 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
SfnO70456 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SfnO70456 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SfnO70456 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SfnO70456 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SfnO70456 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SfnO70456 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SfnO70456 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SfnO70456 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SfnO70456 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SfnO70456 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SfnO70456 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SfnO70456 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SfnO70456 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SfnO70456 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SfnO70456 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SfnO70456 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SfnO70456 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SfnO70456 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SfnO70456 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SfnO70456 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SfnO70456 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SfnO70456 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SfnO70456 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SfnO70456 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SfnO70456 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SfnO70456 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SfnO70456 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SfnO70456 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SfnO70456 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SfnO70456 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SfnO70456 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SfnO70456 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SfnO70456 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SfnO70456 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SfnO70456 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SfnO70456 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SfnO70456 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SfnO70456 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SfnO70456 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SfnO70456 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SfnO70456 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SfnO70456 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SfnO70456 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SfnO70456 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SfnO70456 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SfnO70456 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SfnO70456 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SfnO70456 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SfnO70456 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SfnO70456 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SfnO70456 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SfnO70456 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SfnO70456 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SfnO70456 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SfnO70456 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SfnO70456 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SfnO70456 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SfnO70456 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SfnO70456 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SfnO70456 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SfnO70456 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SfnO70456 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SfnO70456 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SfnO70456 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SfnO70456 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SfnO70456 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SfnO70456 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SfnO70456 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SfnO70456 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SfnO70456 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SfnO70456 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SfnO70456 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SfnO70456 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SfnO70456 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SfnO70456 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SfnO70456 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SfnO70456 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms