Protein–RNA interactions for Protein: O55230

Rad51d, DNA repair protein RAD51 homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad51dO55230 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rad51dO55230 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rad51dO55230 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rad51dO55230 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rad51dO55230 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Rad51dO55230 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rad51dO55230 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rad51dO55230 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rad51dO55230 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rad51dO55230 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rad51dO55230 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rad51dO55230 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rad51dO55230 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rad51dO55230 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rad51dO55230 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rad51dO55230 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rad51dO55230 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Rad51dO55230 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rad51dO55230 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rad51dO55230 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rad51dO55230 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Rad51dO55230 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rad51dO55230 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rad51dO55230 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rad51dO55230 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rad51dO55230 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rad51dO55230 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rad51dO55230 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rad51dO55230 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rad51dO55230 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rad51dO55230 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rad51dO55230 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Rad51dO55230 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Rad51dO55230 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rad51dO55230 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Rad51dO55230 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rad51dO55230 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rad51dO55230 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rad51dO55230 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rad51dO55230 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rad51dO55230 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rad51dO55230 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rad51dO55230 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rad51dO55230 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rad51dO55230 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rad51dO55230 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rad51dO55230 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rad51dO55230 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rad51dO55230 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rad51dO55230 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rad51dO55230 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rad51dO55230 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rad51dO55230 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rad51dO55230 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rad51dO55230 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rad51dO55230 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rad51dO55230 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rad51dO55230 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rad51dO55230 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rad51dO55230 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rad51dO55230 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rad51dO55230 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rad51dO55230 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rad51dO55230 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rad51dO55230 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rad51dO55230 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rad51dO55230 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rad51dO55230 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rad51dO55230 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rad51dO55230 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rad51dO55230 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rad51dO55230 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rad51dO55230 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rad51dO55230 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rad51dO55230 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Rad51dO55230 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rad51dO55230 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rad51dO55230 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rad51dO55230 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rad51dO55230 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rad51dO55230 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Rad51dO55230 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rad51dO55230 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rad51dO55230 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rad51dO55230 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rad51dO55230 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rad51dO55230 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rad51dO55230 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rad51dO55230 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Rad51dO55230 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rad51dO55230 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rad51dO55230 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rad51dO55230 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rad51dO55230 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rad51dO55230 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rad51dO55230 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Rad51dO55230 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rad51dO55230 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rad51dO55230 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rad51dO55230 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms