Protein–RNA interactions for Protein: O55042

Snca, Alpha-synuclein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SncaO55042 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SncaO55042 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SncaO55042 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SncaO55042 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SncaO55042 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SncaO55042 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SncaO55042 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SncaO55042 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SncaO55042 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SncaO55042 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SncaO55042 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SncaO55042 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SncaO55042 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SncaO55042 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SncaO55042 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SncaO55042 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SncaO55042 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SncaO55042 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SncaO55042 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SncaO55042 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SncaO55042 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SncaO55042 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SncaO55042 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SncaO55042 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SncaO55042 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SncaO55042 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SncaO55042 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SncaO55042 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SncaO55042 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SncaO55042 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SncaO55042 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SncaO55042 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SncaO55042 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SncaO55042 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SncaO55042 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SncaO55042 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SncaO55042 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SncaO55042 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SncaO55042 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SncaO55042 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SncaO55042 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SncaO55042 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SncaO55042 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SncaO55042 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SncaO55042 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SncaO55042 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SncaO55042 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SncaO55042 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SncaO55042 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SncaO55042 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SncaO55042 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SncaO55042 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SncaO55042 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SncaO55042 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SncaO55042 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SncaO55042 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SncaO55042 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SncaO55042 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SncaO55042 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SncaO55042 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SncaO55042 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SncaO55042 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SncaO55042 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SncaO55042 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SncaO55042 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SncaO55042 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SncaO55042 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SncaO55042 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SncaO55042 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SncaO55042 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SncaO55042 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SncaO55042 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SncaO55042 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SncaO55042 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SncaO55042 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SncaO55042 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SncaO55042 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SncaO55042 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SncaO55042 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SncaO55042 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SncaO55042 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SncaO55042 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SncaO55042 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SncaO55042 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SncaO55042 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SncaO55042 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SncaO55042 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SncaO55042 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SncaO55042 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SncaO55042 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SncaO55042 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SncaO55042 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SncaO55042 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SncaO55042 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SncaO55042 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SncaO55042 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SncaO55042 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SncaO55042 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SncaO55042 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SncaO55042 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms