Protein–RNA interactions for Protein: O35452

Tnxb, Tenascin X, mousemouse

Predictions only

Length 4,006 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnxbO35452 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TnxbO35452 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
TnxbO35452 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TnxbO35452 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TnxbO35452 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TnxbO35452 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TnxbO35452 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TnxbO35452 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TnxbO35452 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TnxbO35452 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TnxbO35452 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TnxbO35452 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TnxbO35452 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TnxbO35452 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TnxbO35452 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
TnxbO35452 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TnxbO35452 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TnxbO35452 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
TnxbO35452 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
TnxbO35452 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TnxbO35452 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TnxbO35452 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TnxbO35452 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TnxbO35452 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TnxbO35452 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TnxbO35452 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TnxbO35452 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TnxbO35452 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TnxbO35452 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TnxbO35452 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TnxbO35452 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TnxbO35452 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TnxbO35452 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TnxbO35452 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TnxbO35452 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TnxbO35452 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TnxbO35452 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TnxbO35452 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TnxbO35452 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TnxbO35452 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TnxbO35452 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TnxbO35452 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TnxbO35452 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TnxbO35452 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TnxbO35452 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TnxbO35452 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TnxbO35452 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TnxbO35452 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TnxbO35452 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TnxbO35452 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TnxbO35452 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TnxbO35452 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TnxbO35452 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TnxbO35452 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TnxbO35452 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TnxbO35452 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TnxbO35452 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TnxbO35452 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TnxbO35452 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TnxbO35452 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TnxbO35452 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TnxbO35452 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
TnxbO35452 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TnxbO35452 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TnxbO35452 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TnxbO35452 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TnxbO35452 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
TnxbO35452 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TnxbO35452 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TnxbO35452 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TnxbO35452 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TnxbO35452 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TnxbO35452 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TnxbO35452 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TnxbO35452 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TnxbO35452 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TnxbO35452 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TnxbO35452 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TnxbO35452 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TnxbO35452 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
TnxbO35452 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TnxbO35452 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TnxbO35452 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TnxbO35452 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
TnxbO35452 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TnxbO35452 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TnxbO35452 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TnxbO35452 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TnxbO35452 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TnxbO35452 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
TnxbO35452 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TnxbO35452 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TnxbO35452 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TnxbO35452 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TnxbO35452 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TnxbO35452 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TnxbO35452 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TnxbO35452 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TnxbO35452 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TnxbO35452 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms