Protein–RNA interactions for Protein: O35379

Abcc1, Multidrug resistance-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc1O35379 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC31.06■■■□□ 2.56
Abcc1O35379 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Abcc1O35379 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
Abcc1O35379 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Abcc1O35379 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Abcc1O35379 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Abcc1O35379 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Abcc1O35379 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
Abcc1O35379 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
Abcc1O35379 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Abcc1O35379 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Abcc1O35379 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Abcc1O35379 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Abcc1O35379 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
Abcc1O35379 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Abcc1O35379 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Abcc1O35379 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Abcc1O35379 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Abcc1O35379 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Abcc1O35379 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Abcc1O35379 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Abcc1O35379 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Abcc1O35379 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC31.03■■■□□ 2.56
Abcc1O35379 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Abcc1O35379 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
Abcc1O35379 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Abcc1O35379 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Abcc1O35379 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Abcc1O35379 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Abcc1O35379 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
Abcc1O35379 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Abcc1O35379 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Abcc1O35379 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Abcc1O35379 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.56
Abcc1O35379 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
Abcc1O35379 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
Abcc1O35379 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
Abcc1O35379 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.55
Abcc1O35379 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Abcc1O35379 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Abcc1O35379 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Abcc1O35379 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC31■■■□□ 2.55
Abcc1O35379 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC31■■■□□ 2.55
Abcc1O35379 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC31■■■□□ 2.55
Abcc1O35379 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Abcc1O35379 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
Abcc1O35379 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Abcc1O35379 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Abcc1O35379 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Abcc1O35379 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Abcc1O35379 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Abcc1O35379 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
Abcc1O35379 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Abcc1O35379 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Abcc1O35379 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Abcc1O35379 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Abcc1O35379 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Abcc1O35379 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Abcc1O35379 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Abcc1O35379 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Abcc1O35379 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Abcc1O35379 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Abcc1O35379 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Abcc1O35379 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
Abcc1O35379 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
Abcc1O35379 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC30.94■■■□□ 2.54
Abcc1O35379 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Abcc1O35379 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Abcc1O35379 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Abcc1O35379 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Abcc1O35379 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Abcc1O35379 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Abcc1O35379 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Abcc1O35379 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Abcc1O35379 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Abcc1O35379 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
Abcc1O35379 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Abcc1O35379 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Abcc1O35379 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Abcc1O35379 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Abcc1O35379 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Abcc1O35379 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
Abcc1O35379 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Abcc1O35379 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Abcc1O35379 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
Abcc1O35379 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
Abcc1O35379 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Abcc1O35379 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
Abcc1O35379 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC30.89■■■□□ 2.54
Abcc1O35379 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
Abcc1O35379 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Abcc1O35379 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Abcc1O35379 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Abcc1O35379 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC30.89■■■□□ 2.53
Abcc1O35379 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Abcc1O35379 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Abcc1O35379 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
Abcc1O35379 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Abcc1O35379 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Abcc1O35379 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms