Protein–RNA interactions for Protein: O35324

Sh2d1b, SH2 domain-containing protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d1bO35324 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sh2d1bO35324 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Sh2d1bO35324 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sh2d1bO35324 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sh2d1bO35324 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sh2d1bO35324 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sh2d1bO35324 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sh2d1bO35324 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sh2d1bO35324 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sh2d1bO35324 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sh2d1bO35324 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Sh2d1bO35324 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sh2d1bO35324 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sh2d1bO35324 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sh2d1bO35324 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Sh2d1bO35324 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sh2d1bO35324 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sh2d1bO35324 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sh2d1bO35324 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sh2d1bO35324 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sh2d1bO35324 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sh2d1bO35324 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sh2d1bO35324 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sh2d1bO35324 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sh2d1bO35324 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sh2d1bO35324 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sh2d1bO35324 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sh2d1bO35324 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sh2d1bO35324 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sh2d1bO35324 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sh2d1bO35324 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sh2d1bO35324 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sh2d1bO35324 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sh2d1bO35324 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sh2d1bO35324 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sh2d1bO35324 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sh2d1bO35324 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sh2d1bO35324 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Sh2d1bO35324 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sh2d1bO35324 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sh2d1bO35324 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sh2d1bO35324 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sh2d1bO35324 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sh2d1bO35324 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sh2d1bO35324 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sh2d1bO35324 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sh2d1bO35324 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sh2d1bO35324 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sh2d1bO35324 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sh2d1bO35324 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sh2d1bO35324 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sh2d1bO35324 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sh2d1bO35324 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sh2d1bO35324 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sh2d1bO35324 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sh2d1bO35324 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sh2d1bO35324 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Sh2d1bO35324 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Sh2d1bO35324 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sh2d1bO35324 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sh2d1bO35324 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sh2d1bO35324 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sh2d1bO35324 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sh2d1bO35324 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sh2d1bO35324 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sh2d1bO35324 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sh2d1bO35324 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sh2d1bO35324 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sh2d1bO35324 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sh2d1bO35324 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sh2d1bO35324 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sh2d1bO35324 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Sh2d1bO35324 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sh2d1bO35324 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sh2d1bO35324 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sh2d1bO35324 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sh2d1bO35324 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sh2d1bO35324 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sh2d1bO35324 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sh2d1bO35324 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sh2d1bO35324 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sh2d1bO35324 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sh2d1bO35324 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sh2d1bO35324 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sh2d1bO35324 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sh2d1bO35324 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sh2d1bO35324 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sh2d1bO35324 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sh2d1bO35324 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sh2d1bO35324 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sh2d1bO35324 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sh2d1bO35324 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sh2d1bO35324 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sh2d1bO35324 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sh2d1bO35324 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sh2d1bO35324 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sh2d1bO35324 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sh2d1bO35324 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sh2d1bO35324 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sh2d1bO35324 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms