Protein–RNA interactions for Protein: J3QPR6

Rfpl4b, MCG1377, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfpl4bJ3QPR6 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rfpl4bJ3QPR6 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rfpl4bJ3QPR6 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rfpl4bJ3QPR6 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Rfpl4bJ3QPR6 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rfpl4bJ3QPR6 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rfpl4bJ3QPR6 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rfpl4bJ3QPR6 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rfpl4bJ3QPR6 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Rfpl4bJ3QPR6 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rfpl4bJ3QPR6 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rfpl4bJ3QPR6 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rfpl4bJ3QPR6 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rfpl4bJ3QPR6 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rfpl4bJ3QPR6 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rfpl4bJ3QPR6 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rfpl4bJ3QPR6 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rfpl4bJ3QPR6 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rfpl4bJ3QPR6 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rfpl4bJ3QPR6 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rfpl4bJ3QPR6 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rfpl4bJ3QPR6 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rfpl4bJ3QPR6 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rfpl4bJ3QPR6 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rfpl4bJ3QPR6 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rfpl4bJ3QPR6 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rfpl4bJ3QPR6 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rfpl4bJ3QPR6 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Rfpl4bJ3QPR6 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rfpl4bJ3QPR6 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rfpl4bJ3QPR6 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rfpl4bJ3QPR6 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rfpl4bJ3QPR6 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rfpl4bJ3QPR6 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rfpl4bJ3QPR6 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rfpl4bJ3QPR6 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rfpl4bJ3QPR6 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rfpl4bJ3QPR6 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rfpl4bJ3QPR6 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Rfpl4bJ3QPR6 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rfpl4bJ3QPR6 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rfpl4bJ3QPR6 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rfpl4bJ3QPR6 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rfpl4bJ3QPR6 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rfpl4bJ3QPR6 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rfpl4bJ3QPR6 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rfpl4bJ3QPR6 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rfpl4bJ3QPR6 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rfpl4bJ3QPR6 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rfpl4bJ3QPR6 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rfpl4bJ3QPR6 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rfpl4bJ3QPR6 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rfpl4bJ3QPR6 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rfpl4bJ3QPR6 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rfpl4bJ3QPR6 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rfpl4bJ3QPR6 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rfpl4bJ3QPR6 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rfpl4bJ3QPR6 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rfpl4bJ3QPR6 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rfpl4bJ3QPR6 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rfpl4bJ3QPR6 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rfpl4bJ3QPR6 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rfpl4bJ3QPR6 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rfpl4bJ3QPR6 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rfpl4bJ3QPR6 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rfpl4bJ3QPR6 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rfpl4bJ3QPR6 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rfpl4bJ3QPR6 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Rfpl4bJ3QPR6 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rfpl4bJ3QPR6 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rfpl4bJ3QPR6 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rfpl4bJ3QPR6 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rfpl4bJ3QPR6 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rfpl4bJ3QPR6 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rfpl4bJ3QPR6 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rfpl4bJ3QPR6 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rfpl4bJ3QPR6 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rfpl4bJ3QPR6 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rfpl4bJ3QPR6 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rfpl4bJ3QPR6 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rfpl4bJ3QPR6 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rfpl4bJ3QPR6 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rfpl4bJ3QPR6 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rfpl4bJ3QPR6 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rfpl4bJ3QPR6 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rfpl4bJ3QPR6 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Rfpl4bJ3QPR6 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rfpl4bJ3QPR6 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rfpl4bJ3QPR6 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rfpl4bJ3QPR6 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rfpl4bJ3QPR6 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rfpl4bJ3QPR6 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rfpl4bJ3QPR6 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rfpl4bJ3QPR6 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Rfpl4bJ3QPR6 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rfpl4bJ3QPR6 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rfpl4bJ3QPR6 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rfpl4bJ3QPR6 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rfpl4bJ3QPR6 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rfpl4bJ3QPR6 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms