Protein–RNA interactions for Protein: J3QP53

Gm5294, Predicted gene 5294, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5294J3QP53 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5294J3QP53 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5294J3QP53 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5294J3QP53 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5294J3QP53 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5294J3QP53 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5294J3QP53 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5294J3QP53 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5294J3QP53 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5294J3QP53 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5294J3QP53 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5294J3QP53 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5294J3QP53 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5294J3QP53 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5294J3QP53 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5294J3QP53 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5294J3QP53 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5294J3QP53 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5294J3QP53 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5294J3QP53 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5294J3QP53 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5294J3QP53 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5294J3QP53 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5294J3QP53 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5294J3QP53 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5294J3QP53 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5294J3QP53 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5294J3QP53 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5294J3QP53 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5294J3QP53 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5294J3QP53 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5294J3QP53 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5294J3QP53 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5294J3QP53 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5294J3QP53 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5294J3QP53 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5294J3QP53 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5294J3QP53 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5294J3QP53 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5294J3QP53 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5294J3QP53 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5294J3QP53 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5294J3QP53 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5294J3QP53 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5294J3QP53 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5294J3QP53 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5294J3QP53 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5294J3QP53 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5294J3QP53 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5294J3QP53 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5294J3QP53 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5294J3QP53 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5294J3QP53 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5294J3QP53 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5294J3QP53 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5294J3QP53 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5294J3QP53 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5294J3QP53 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5294J3QP53 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5294J3QP53 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5294J3QP53 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5294J3QP53 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5294J3QP53 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5294J3QP53 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5294J3QP53 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5294J3QP53 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5294J3QP53 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5294J3QP53 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5294J3QP53 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5294J3QP53 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5294J3QP53 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5294J3QP53 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5294J3QP53 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5294J3QP53 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5294J3QP53 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5294J3QP53 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5294J3QP53 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5294J3QP53 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5294J3QP53 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5294J3QP53 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5294J3QP53 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5294J3QP53 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5294J3QP53 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5294J3QP53 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5294J3QP53 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5294J3QP53 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5294J3QP53 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5294J3QP53 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5294J3QP53 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5294J3QP53 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5294J3QP53 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5294J3QP53 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5294J3QP53 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5294J3QP53 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5294J3QP53 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm5294J3QP53 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm5294J3QP53 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm5294J3QP53 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm5294J3QP53 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm5294J3QP53 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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