Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS0

Gm21411, Predicted gene, 21411, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21411J3KMS0 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm21411J3KMS0 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm21411J3KMS0 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm21411J3KMS0 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm21411J3KMS0 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm21411J3KMS0 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm21411J3KMS0 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm21411J3KMS0 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm21411J3KMS0 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm21411J3KMS0 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm21411J3KMS0 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm21411J3KMS0 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm21411J3KMS0 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm21411J3KMS0 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm21411J3KMS0 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm21411J3KMS0 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm21411J3KMS0 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm21411J3KMS0 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm21411J3KMS0 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm21411J3KMS0 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm21411J3KMS0 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm21411J3KMS0 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm21411J3KMS0 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm21411J3KMS0 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm21411J3KMS0 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm21411J3KMS0 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm21411J3KMS0 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm21411J3KMS0 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm21411J3KMS0 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm21411J3KMS0 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm21411J3KMS0 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm21411J3KMS0 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm21411J3KMS0 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm21411J3KMS0 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm21411J3KMS0 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm21411J3KMS0 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm21411J3KMS0 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm21411J3KMS0 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm21411J3KMS0 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm21411J3KMS0 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm21411J3KMS0 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm21411J3KMS0 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm21411J3KMS0 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm21411J3KMS0 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gm21411J3KMS0 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gm21411J3KMS0 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm21411J3KMS0 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm21411J3KMS0 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm21411J3KMS0 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm21411J3KMS0 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm21411J3KMS0 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm21411J3KMS0 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm21411J3KMS0 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm21411J3KMS0 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm21411J3KMS0 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm21411J3KMS0 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm21411J3KMS0 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm21411J3KMS0 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm21411J3KMS0 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm21411J3KMS0 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm21411J3KMS0 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm21411J3KMS0 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm21411J3KMS0 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm21411J3KMS0 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm21411J3KMS0 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm21411J3KMS0 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm21411J3KMS0 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm21411J3KMS0 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm21411J3KMS0 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm21411J3KMS0 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm21411J3KMS0 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm21411J3KMS0 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm21411J3KMS0 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm21411J3KMS0 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm21411J3KMS0 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm21411J3KMS0 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm21411J3KMS0 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm21411J3KMS0 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm21411J3KMS0 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm21411J3KMS0 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm21411J3KMS0 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm21411J3KMS0 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm21411J3KMS0 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm21411J3KMS0 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm21411J3KMS0 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm21411J3KMS0 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm21411J3KMS0 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm21411J3KMS0 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm21411J3KMS0 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm21411J3KMS0 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm21411J3KMS0 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm21411J3KMS0 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm21411J3KMS0 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm21411J3KMS0 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm21411J3KMS0 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm21411J3KMS0 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm21411J3KMS0 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm21411J3KMS0 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm21411J3KMS0 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm21411J3KMS0 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
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