Protein–RNA interactions for Protein: G5E870

Trip12, E3 ubiquitin-protein ligase TRIP12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip12G5E870 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trip12G5E870 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trip12G5E870 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trip12G5E870 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trip12G5E870 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trip12G5E870 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trip12G5E870 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Trip12G5E870 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trip12G5E870 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trip12G5E870 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trip12G5E870 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trip12G5E870 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Trip12G5E870 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trip12G5E870 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Trip12G5E870 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trip12G5E870 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trip12G5E870 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trip12G5E870 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trip12G5E870 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trip12G5E870 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trip12G5E870 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trip12G5E870 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trip12G5E870 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trip12G5E870 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trip12G5E870 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trip12G5E870 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trip12G5E870 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trip12G5E870 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trip12G5E870 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trip12G5E870 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trip12G5E870 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trip12G5E870 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trip12G5E870 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trip12G5E870 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trip12G5E870 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trip12G5E870 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trip12G5E870 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trip12G5E870 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trip12G5E870 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trip12G5E870 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trip12G5E870 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trip12G5E870 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trip12G5E870 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trip12G5E870 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Trip12G5E870 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trip12G5E870 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trip12G5E870 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trip12G5E870 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trip12G5E870 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trip12G5E870 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trip12G5E870 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trip12G5E870 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trip12G5E870 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trip12G5E870 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trip12G5E870 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trip12G5E870 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trip12G5E870 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trip12G5E870 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trip12G5E870 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trip12G5E870 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trip12G5E870 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trip12G5E870 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trip12G5E870 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trip12G5E870 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trip12G5E870 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Trip12G5E870 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trip12G5E870 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trip12G5E870 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trip12G5E870 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trip12G5E870 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trip12G5E870 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trip12G5E870 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trip12G5E870 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trip12G5E870 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trip12G5E870 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trip12G5E870 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Trip12G5E870 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trip12G5E870 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trip12G5E870 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trip12G5E870 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trip12G5E870 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trip12G5E870 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trip12G5E870 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trip12G5E870 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Trip12G5E870 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trip12G5E870 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trip12G5E870 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trip12G5E870 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trip12G5E870 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trip12G5E870 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trip12G5E870 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trip12G5E870 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trip12G5E870 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trip12G5E870 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trip12G5E870 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trip12G5E870 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trip12G5E870 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trip12G5E870 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trip12G5E870 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trip12G5E870 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms