Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U3

Vmn1r58, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r58G3X9U3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vmn1r58G3X9U3 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vmn1r58G3X9U3 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vmn1r58G3X9U3 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vmn1r58G3X9U3 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vmn1r58G3X9U3 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vmn1r58G3X9U3 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vmn1r58G3X9U3 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vmn1r58G3X9U3 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vmn1r58G3X9U3 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vmn1r58G3X9U3 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vmn1r58G3X9U3 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vmn1r58G3X9U3 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vmn1r58G3X9U3 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vmn1r58G3X9U3 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Vmn1r58G3X9U3 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vmn1r58G3X9U3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vmn1r58G3X9U3 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vmn1r58G3X9U3 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vmn1r58G3X9U3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Vmn1r58G3X9U3 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vmn1r58G3X9U3 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vmn1r58G3X9U3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vmn1r58G3X9U3 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Vmn1r58G3X9U3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vmn1r58G3X9U3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vmn1r58G3X9U3 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vmn1r58G3X9U3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vmn1r58G3X9U3 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vmn1r58G3X9U3 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vmn1r58G3X9U3 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vmn1r58G3X9U3 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vmn1r58G3X9U3 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Vmn1r58G3X9U3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vmn1r58G3X9U3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vmn1r58G3X9U3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vmn1r58G3X9U3 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vmn1r58G3X9U3 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vmn1r58G3X9U3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vmn1r58G3X9U3 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vmn1r58G3X9U3 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vmn1r58G3X9U3 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vmn1r58G3X9U3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vmn1r58G3X9U3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vmn1r58G3X9U3 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vmn1r58G3X9U3 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vmn1r58G3X9U3 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vmn1r58G3X9U3 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vmn1r58G3X9U3 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vmn1r58G3X9U3 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vmn1r58G3X9U3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vmn1r58G3X9U3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vmn1r58G3X9U3 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vmn1r58G3X9U3 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vmn1r58G3X9U3 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vmn1r58G3X9U3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vmn1r58G3X9U3 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vmn1r58G3X9U3 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vmn1r58G3X9U3 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vmn1r58G3X9U3 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vmn1r58G3X9U3 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vmn1r58G3X9U3 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Vmn1r58G3X9U3 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vmn1r58G3X9U3 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vmn1r58G3X9U3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vmn1r58G3X9U3 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vmn1r58G3X9U3 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vmn1r58G3X9U3 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Vmn1r58G3X9U3 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vmn1r58G3X9U3 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vmn1r58G3X9U3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vmn1r58G3X9U3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vmn1r58G3X9U3 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vmn1r58G3X9U3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vmn1r58G3X9U3 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vmn1r58G3X9U3 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vmn1r58G3X9U3 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vmn1r58G3X9U3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vmn1r58G3X9U3 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vmn1r58G3X9U3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vmn1r58G3X9U3 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vmn1r58G3X9U3 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vmn1r58G3X9U3 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vmn1r58G3X9U3 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vmn1r58G3X9U3 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vmn1r58G3X9U3 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vmn1r58G3X9U3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vmn1r58G3X9U3 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vmn1r58G3X9U3 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vmn1r58G3X9U3 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vmn1r58G3X9U3 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vmn1r58G3X9U3 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vmn1r58G3X9U3 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vmn1r58G3X9U3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vmn1r58G3X9U3 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vmn1r58G3X9U3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vmn1r58G3X9U3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vmn1r58G3X9U3 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vmn1r58G3X9U3 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vmn1r58G3X9U3 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms