Protein–RNA interactions for Protein: G3UW52

Cldn34a, Claudin 34A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34aG3UW52 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cldn34aG3UW52 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cldn34aG3UW52 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cldn34aG3UW52 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cldn34aG3UW52 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Cldn34aG3UW52 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cldn34aG3UW52 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cldn34aG3UW52 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cldn34aG3UW52 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cldn34aG3UW52 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cldn34aG3UW52 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cldn34aG3UW52 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cldn34aG3UW52 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cldn34aG3UW52 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cldn34aG3UW52 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cldn34aG3UW52 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cldn34aG3UW52 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cldn34aG3UW52 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cldn34aG3UW52 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cldn34aG3UW52 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cldn34aG3UW52 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cldn34aG3UW52 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cldn34aG3UW52 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Cldn34aG3UW52 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cldn34aG3UW52 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cldn34aG3UW52 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cldn34aG3UW52 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cldn34aG3UW52 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cldn34aG3UW52 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cldn34aG3UW52 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cldn34aG3UW52 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cldn34aG3UW52 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cldn34aG3UW52 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cldn34aG3UW52 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cldn34aG3UW52 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cldn34aG3UW52 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn34aG3UW52 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn34aG3UW52 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn34aG3UW52 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn34aG3UW52 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn34aG3UW52 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn34aG3UW52 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn34aG3UW52 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn34aG3UW52 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn34aG3UW52 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn34aG3UW52 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cldn34aG3UW52 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cldn34aG3UW52 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cldn34aG3UW52 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cldn34aG3UW52 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cldn34aG3UW52 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cldn34aG3UW52 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Cldn34aG3UW52 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Cldn34aG3UW52 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cldn34aG3UW52 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cldn34aG3UW52 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cldn34aG3UW52 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cldn34aG3UW52 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cldn34aG3UW52 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cldn34aG3UW52 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cldn34aG3UW52 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Cldn34aG3UW52 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cldn34aG3UW52 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cldn34aG3UW52 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cldn34aG3UW52 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cldn34aG3UW52 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cldn34aG3UW52 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cldn34aG3UW52 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cldn34aG3UW52 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cldn34aG3UW52 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Cldn34aG3UW52 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cldn34aG3UW52 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cldn34aG3UW52 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cldn34aG3UW52 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Cldn34aG3UW52 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cldn34aG3UW52 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cldn34aG3UW52 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cldn34aG3UW52 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cldn34aG3UW52 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cldn34aG3UW52 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cldn34aG3UW52 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cldn34aG3UW52 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cldn34aG3UW52 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cldn34aG3UW52 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cldn34aG3UW52 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cldn34aG3UW52 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cldn34aG3UW52 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cldn34aG3UW52 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cldn34aG3UW52 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Cldn34aG3UW52 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cldn34aG3UW52 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cldn34aG3UW52 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cldn34aG3UW52 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cldn34aG3UW52 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cldn34aG3UW52 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cldn34aG3UW52 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cldn34aG3UW52 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cldn34aG3UW52 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cldn34aG3UW52 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cldn34aG3UW52 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms