Protein–RNA interactions for Protein: F8VPZ9

Bicra, BRD4-interacting chromatin-remodeling complex-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BicraF8VPZ9 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
BicraF8VPZ9 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC36.63■■■■□ 3.45
BicraF8VPZ9 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
BicraF8VPZ9 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
BicraF8VPZ9 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
BicraF8VPZ9 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC36.62■■■■□ 3.45
BicraF8VPZ9 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
BicraF8VPZ9 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
BicraF8VPZ9 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
BicraF8VPZ9 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
BicraF8VPZ9 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
BicraF8VPZ9 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC36.61■■■■□ 3.45
BicraF8VPZ9 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
BicraF8VPZ9 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
BicraF8VPZ9 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
BicraF8VPZ9 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC36.61■■■■□ 3.45
BicraF8VPZ9 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
BicraF8VPZ9 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
BicraF8VPZ9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
BicraF8VPZ9 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
BicraF8VPZ9 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
BicraF8VPZ9 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
BicraF8VPZ9 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
BicraF8VPZ9 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC36.6■■■■□ 3.45
BicraF8VPZ9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC36.59■■■■□ 3.45
BicraF8VPZ9 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
BicraF8VPZ9 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC36.59■■■■□ 3.45
BicraF8VPZ9 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
BicraF8VPZ9 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
BicraF8VPZ9 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.58■■■■□ 3.45
BicraF8VPZ9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
BicraF8VPZ9 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC36.57■■■■□ 3.44
BicraF8VPZ9 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
BicraF8VPZ9 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
BicraF8VPZ9 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
BicraF8VPZ9 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
BicraF8VPZ9 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
BicraF8VPZ9 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
BicraF8VPZ9 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
BicraF8VPZ9 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC36.55■■■■□ 3.44
BicraF8VPZ9 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
BicraF8VPZ9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC36.55■■■■□ 3.44
BicraF8VPZ9 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
BicraF8VPZ9 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
BicraF8VPZ9 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC36.53■■■■□ 3.44
BicraF8VPZ9 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC36.53■■■■□ 3.44
BicraF8VPZ9 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
BicraF8VPZ9 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC36.53■■■■□ 3.44
BicraF8VPZ9 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
BicraF8VPZ9 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
BicraF8VPZ9 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
BicraF8VPZ9 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
BicraF8VPZ9 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
BicraF8VPZ9 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
BicraF8VPZ9 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
BicraF8VPZ9 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
BicraF8VPZ9 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
BicraF8VPZ9 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
BicraF8VPZ9 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.43
BicraF8VPZ9 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
BicraF8VPZ9 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
BicraF8VPZ9 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
BicraF8VPZ9 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
BicraF8VPZ9 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
BicraF8VPZ9 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
BicraF8VPZ9 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC36.49■■■■□ 3.43
BicraF8VPZ9 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
BicraF8VPZ9 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
BicraF8VPZ9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
BicraF8VPZ9 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC36.48■■■■□ 3.43
BicraF8VPZ9 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
BicraF8VPZ9 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
BicraF8VPZ9 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
BicraF8VPZ9 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
BicraF8VPZ9 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
BicraF8VPZ9 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
BicraF8VPZ9 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC36.46■■■■□ 3.43
BicraF8VPZ9 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
BicraF8VPZ9 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
BicraF8VPZ9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
BicraF8VPZ9 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
BicraF8VPZ9 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.43
BicraF8VPZ9 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.43
BicraF8VPZ9 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.42
BicraF8VPZ9 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
BicraF8VPZ9 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
BicraF8VPZ9 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
BicraF8VPZ9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
BicraF8VPZ9 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
BicraF8VPZ9 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
BicraF8VPZ9 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC36.44■■■■□ 3.42
BicraF8VPZ9 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
BicraF8VPZ9 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
BicraF8VPZ9 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
BicraF8VPZ9 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC36.43■■■■□ 3.42
BicraF8VPZ9 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
BicraF8VPZ9 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
BicraF8VPZ9 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC36.42■■■■□ 3.42
BicraF8VPZ9 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
BicraF8VPZ9 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms