Protein–RNA interactions for Protein: F6XX07

Gm21970, Predicted gene 21970 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21970F6XX07 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm21970F6XX07 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm21970F6XX07 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm21970F6XX07 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm21970F6XX07 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm21970F6XX07 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm21970F6XX07 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm21970F6XX07 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm21970F6XX07 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm21970F6XX07 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm21970F6XX07 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm21970F6XX07 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm21970F6XX07 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm21970F6XX07 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm21970F6XX07 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm21970F6XX07 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm21970F6XX07 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm21970F6XX07 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm21970F6XX07 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm21970F6XX07 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm21970F6XX07 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm21970F6XX07 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm21970F6XX07 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm21970F6XX07 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm21970F6XX07 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm21970F6XX07 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm21970F6XX07 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm21970F6XX07 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm21970F6XX07 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm21970F6XX07 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm21970F6XX07 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm21970F6XX07 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm21970F6XX07 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm21970F6XX07 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm21970F6XX07 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm21970F6XX07 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm21970F6XX07 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm21970F6XX07 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm21970F6XX07 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm21970F6XX07 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm21970F6XX07 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm21970F6XX07 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm21970F6XX07 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm21970F6XX07 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm21970F6XX07 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm21970F6XX07 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm21970F6XX07 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm21970F6XX07 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm21970F6XX07 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm21970F6XX07 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm21970F6XX07 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm21970F6XX07 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm21970F6XX07 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm21970F6XX07 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm21970F6XX07 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm21970F6XX07 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm21970F6XX07 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm21970F6XX07 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm21970F6XX07 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm21970F6XX07 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm21970F6XX07 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm21970F6XX07 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm21970F6XX07 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm21970F6XX07 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm21970F6XX07 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm21970F6XX07 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm21970F6XX07 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm21970F6XX07 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm21970F6XX07 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm21970F6XX07 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm21970F6XX07 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm21970F6XX07 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm21970F6XX07 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm21970F6XX07 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm21970F6XX07 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm21970F6XX07 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm21970F6XX07 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm21970F6XX07 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm21970F6XX07 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm21970F6XX07 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm21970F6XX07 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm21970F6XX07 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm21970F6XX07 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm21970F6XX07 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm21970F6XX07 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm21970F6XX07 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm21970F6XX07 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm21970F6XX07 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm21970F6XX07 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm21970F6XX07 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm21970F6XX07 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm21970F6XX07 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm21970F6XX07 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm21970F6XX07 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm21970F6XX07 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm21970F6XX07 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm21970F6XX07 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm21970F6XX07 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm21970F6XX07 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm21970F6XX07 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms