Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9R3

4930451I11Rik, RIKEN cDNA 4930451I11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930451I11RikE9Q9R3 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930451I11RikE9Q9R3 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
4930451I11RikE9Q9R3 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930451I11RikE9Q9R3 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930451I11RikE9Q9R3 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930451I11RikE9Q9R3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930451I11RikE9Q9R3 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930451I11RikE9Q9R3 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930451I11RikE9Q9R3 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930451I11RikE9Q9R3 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
4930451I11RikE9Q9R3 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4930451I11RikE9Q9R3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4930451I11RikE9Q9R3 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4930451I11RikE9Q9R3 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
4930451I11RikE9Q9R3 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
4930451I11RikE9Q9R3 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4930451I11RikE9Q9R3 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4930451I11RikE9Q9R3 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4930451I11RikE9Q9R3 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4930451I11RikE9Q9R3 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930451I11RikE9Q9R3 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930451I11RikE9Q9R3 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930451I11RikE9Q9R3 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930451I11RikE9Q9R3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930451I11RikE9Q9R3 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930451I11RikE9Q9R3 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930451I11RikE9Q9R3 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930451I11RikE9Q9R3 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930451I11RikE9Q9R3 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
4930451I11RikE9Q9R3 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930451I11RikE9Q9R3 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930451I11RikE9Q9R3 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930451I11RikE9Q9R3 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930451I11RikE9Q9R3 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930451I11RikE9Q9R3 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930451I11RikE9Q9R3 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930451I11RikE9Q9R3 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930451I11RikE9Q9R3 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930451I11RikE9Q9R3 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930451I11RikE9Q9R3 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4930451I11RikE9Q9R3 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
4930451I11RikE9Q9R3 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
4930451I11RikE9Q9R3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4930451I11RikE9Q9R3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4930451I11RikE9Q9R3 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4930451I11RikE9Q9R3 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4930451I11RikE9Q9R3 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
4930451I11RikE9Q9R3 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4930451I11RikE9Q9R3 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4930451I11RikE9Q9R3 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4930451I11RikE9Q9R3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
4930451I11RikE9Q9R3 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
4930451I11RikE9Q9R3 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
4930451I11RikE9Q9R3 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
4930451I11RikE9Q9R3 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
4930451I11RikE9Q9R3 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
4930451I11RikE9Q9R3 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
4930451I11RikE9Q9R3 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
4930451I11RikE9Q9R3 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
4930451I11RikE9Q9R3 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4930451I11RikE9Q9R3 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
4930451I11RikE9Q9R3 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4930451I11RikE9Q9R3 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
4930451I11RikE9Q9R3 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
4930451I11RikE9Q9R3 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
4930451I11RikE9Q9R3 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4930451I11RikE9Q9R3 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4930451I11RikE9Q9R3 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4930451I11RikE9Q9R3 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
4930451I11RikE9Q9R3 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4930451I11RikE9Q9R3 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4930451I11RikE9Q9R3 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4930451I11RikE9Q9R3 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4930451I11RikE9Q9R3 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4930451I11RikE9Q9R3 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
4930451I11RikE9Q9R3 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
4930451I11RikE9Q9R3 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
4930451I11RikE9Q9R3 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4930451I11RikE9Q9R3 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
4930451I11RikE9Q9R3 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
4930451I11RikE9Q9R3 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
4930451I11RikE9Q9R3 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
4930451I11RikE9Q9R3 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
4930451I11RikE9Q9R3 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
4930451I11RikE9Q9R3 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
4930451I11RikE9Q9R3 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
4930451I11RikE9Q9R3 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
4930451I11RikE9Q9R3 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
4930451I11RikE9Q9R3 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
4930451I11RikE9Q9R3 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
4930451I11RikE9Q9R3 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
4930451I11RikE9Q9R3 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
4930451I11RikE9Q9R3 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
4930451I11RikE9Q9R3 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
4930451I11RikE9Q9R3 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
4930451I11RikE9Q9R3 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
4930451I11RikE9Q9R3 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
4930451I11RikE9Q9R3 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
4930451I11RikE9Q9R3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
4930451I11RikE9Q9R3 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.7 ms