Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6W0

BC030500, cDNA sequence BC030500 (Fragment), mousemouse

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Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC030500E9Q6W0 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BC030500E9Q6W0 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BC030500E9Q6W0 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BC030500E9Q6W0 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BC030500E9Q6W0 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BC030500E9Q6W0 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BC030500E9Q6W0 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BC030500E9Q6W0 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BC030500E9Q6W0 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BC030500E9Q6W0 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BC030500E9Q6W0 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BC030500E9Q6W0 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BC030500E9Q6W0 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BC030500E9Q6W0 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BC030500E9Q6W0 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BC030500E9Q6W0 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BC030500E9Q6W0 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BC030500E9Q6W0 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
BC030500E9Q6W0 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
BC030500E9Q6W0 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BC030500E9Q6W0 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BC030500E9Q6W0 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BC030500E9Q6W0 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BC030500E9Q6W0 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BC030500E9Q6W0 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BC030500E9Q6W0 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BC030500E9Q6W0 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BC030500E9Q6W0 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BC030500E9Q6W0 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BC030500E9Q6W0 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BC030500E9Q6W0 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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BC030500E9Q6W0 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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BC030500E9Q6W0 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BC030500E9Q6W0 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BC030500E9Q6W0 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BC030500E9Q6W0 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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BC030500E9Q6W0 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BC030500E9Q6W0 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BC030500E9Q6W0 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BC030500E9Q6W0 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BC030500E9Q6W0 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BC030500E9Q6W0 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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BC030500E9Q6W0 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BC030500E9Q6W0 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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BC030500E9Q6W0 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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BC030500E9Q6W0 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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BC030500E9Q6W0 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BC030500E9Q6W0 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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BC030500E9Q6W0 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BC030500E9Q6W0 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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BC030500E9Q6W0 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BC030500E9Q6W0 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BC030500E9Q6W0 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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BC030500E9Q6W0 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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BC030500E9Q6W0 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BC030500E9Q6W0 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BC030500E9Q6W0 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BC030500E9Q6W0 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BC030500E9Q6W0 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BC030500E9Q6W0 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BC030500E9Q6W0 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BC030500E9Q6W0 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BC030500E9Q6W0 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
BC030500E9Q6W0 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BC030500E9Q6W0 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BC030500E9Q6W0 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BC030500E9Q6W0 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BC030500E9Q6W0 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BC030500E9Q6W0 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BC030500E9Q6W0 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BC030500E9Q6W0 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BC030500E9Q6W0 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BC030500E9Q6W0 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BC030500E9Q6W0 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BC030500E9Q6W0 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BC030500E9Q6W0 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BC030500E9Q6W0 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BC030500E9Q6W0 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BC030500E9Q6W0 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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