Protein–RNA interactions for Protein: E9Q548

Gm20518, Predicted gene 20518, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20518E9Q548 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm20518E9Q548 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm20518E9Q548 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm20518E9Q548 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm20518E9Q548 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm20518E9Q548 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm20518E9Q548 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm20518E9Q548 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm20518E9Q548 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm20518E9Q548 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm20518E9Q548 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm20518E9Q548 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm20518E9Q548 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm20518E9Q548 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm20518E9Q548 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm20518E9Q548 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm20518E9Q548 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm20518E9Q548 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm20518E9Q548 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm20518E9Q548 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm20518E9Q548 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm20518E9Q548 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm20518E9Q548 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm20518E9Q548 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm20518E9Q548 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm20518E9Q548 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm20518E9Q548 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm20518E9Q548 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm20518E9Q548 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm20518E9Q548 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm20518E9Q548 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm20518E9Q548 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm20518E9Q548 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm20518E9Q548 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm20518E9Q548 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm20518E9Q548 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm20518E9Q548 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm20518E9Q548 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm20518E9Q548 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm20518E9Q548 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm20518E9Q548 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm20518E9Q548 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gm20518E9Q548 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gm20518E9Q548 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gm20518E9Q548 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm20518E9Q548 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm20518E9Q548 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm20518E9Q548 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm20518E9Q548 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm20518E9Q548 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm20518E9Q548 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm20518E9Q548 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm20518E9Q548 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm20518E9Q548 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm20518E9Q548 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm20518E9Q548 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm20518E9Q548 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm20518E9Q548 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm20518E9Q548 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm20518E9Q548 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm20518E9Q548 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm20518E9Q548 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm20518E9Q548 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm20518E9Q548 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm20518E9Q548 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm20518E9Q548 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm20518E9Q548 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm20518E9Q548 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm20518E9Q548 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm20518E9Q548 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm20518E9Q548 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm20518E9Q548 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm20518E9Q548 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm20518E9Q548 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm20518E9Q548 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm20518E9Q548 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm20518E9Q548 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm20518E9Q548 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm20518E9Q548 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm20518E9Q548 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm20518E9Q548 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm20518E9Q548 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm20518E9Q548 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm20518E9Q548 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm20518E9Q548 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm20518E9Q548 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm20518E9Q548 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm20518E9Q548 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm20518E9Q548 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm20518E9Q548 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm20518E9Q548 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm20518E9Q548 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm20518E9Q548 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm20518E9Q548 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm20518E9Q548 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm20518E9Q548 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm20518E9Q548 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm20518E9Q548 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm20518E9Q548 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm20518E9Q548 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms