Protein–RNA interactions for Protein: E9Q368

Tarbp1, TAR RNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tarbp1E9Q368 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Tarbp1E9Q368 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Tarbp1E9Q368 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Tarbp1E9Q368 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Tarbp1E9Q368 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Tarbp1E9Q368 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Tarbp1E9Q368 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Tarbp1E9Q368 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Tarbp1E9Q368 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Tarbp1E9Q368 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Tarbp1E9Q368 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Tarbp1E9Q368 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Tarbp1E9Q368 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Tarbp1E9Q368 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Tarbp1E9Q368 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Tarbp1E9Q368 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Tarbp1E9Q368 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Tarbp1E9Q368 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Tarbp1E9Q368 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Tarbp1E9Q368 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Tarbp1E9Q368 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Tarbp1E9Q368 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Tarbp1E9Q368 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Tarbp1E9Q368 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Tarbp1E9Q368 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Tarbp1E9Q368 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Tarbp1E9Q368 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Tarbp1E9Q368 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Tarbp1E9Q368 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.12
Tarbp1E9Q368 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
Tarbp1E9Q368 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
Tarbp1E9Q368 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.12
Tarbp1E9Q368 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
Tarbp1E9Q368 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
Tarbp1E9Q368 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Tarbp1E9Q368 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Tarbp1E9Q368 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Tarbp1E9Q368 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Tarbp1E9Q368 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Tarbp1E9Q368 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Tarbp1E9Q368 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Tarbp1E9Q368 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Tarbp1E9Q368 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Tarbp1E9Q368 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Tarbp1E9Q368 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Tarbp1E9Q368 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Tarbp1E9Q368 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Tarbp1E9Q368 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Tarbp1E9Q368 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Tarbp1E9Q368 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Tarbp1E9Q368 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Tarbp1E9Q368 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Tarbp1E9Q368 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Tarbp1E9Q368 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Tarbp1E9Q368 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Tarbp1E9Q368 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Tarbp1E9Q368 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Tarbp1E9Q368 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Tarbp1E9Q368 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Tarbp1E9Q368 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Tarbp1E9Q368 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Tarbp1E9Q368 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Tarbp1E9Q368 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Tarbp1E9Q368 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Tarbp1E9Q368 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Tarbp1E9Q368 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Tarbp1E9Q368 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Tarbp1E9Q368 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Tarbp1E9Q368 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Tarbp1E9Q368 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Tarbp1E9Q368 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Tarbp1E9Q368 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Tarbp1E9Q368 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Tarbp1E9Q368 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Tarbp1E9Q368 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Tarbp1E9Q368 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Tarbp1E9Q368 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Tarbp1E9Q368 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Tarbp1E9Q368 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Tarbp1E9Q368 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Tarbp1E9Q368 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Tarbp1E9Q368 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Tarbp1E9Q368 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Tarbp1E9Q368 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Tarbp1E9Q368 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Tarbp1E9Q368 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Tarbp1E9Q368 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Tarbp1E9Q368 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Tarbp1E9Q368 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Tarbp1E9Q368 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Tarbp1E9Q368 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Tarbp1E9Q368 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Tarbp1E9Q368 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Tarbp1E9Q368 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Tarbp1E9Q368 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Tarbp1E9Q368 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Tarbp1E9Q368 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Tarbp1E9Q368 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Tarbp1E9Q368 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Tarbp1E9Q368 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms