Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0N7

4930426L09Rik, RIKEN cDNA 4930426L09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930426L09RikE9Q0N7 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
4930426L09RikE9Q0N7 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
4930426L09RikE9Q0N7 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
4930426L09RikE9Q0N7 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
4930426L09RikE9Q0N7 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
4930426L09RikE9Q0N7 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
4930426L09RikE9Q0N7 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
4930426L09RikE9Q0N7 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
4930426L09RikE9Q0N7 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
4930426L09RikE9Q0N7 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
4930426L09RikE9Q0N7 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
4930426L09RikE9Q0N7 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
4930426L09RikE9Q0N7 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
4930426L09RikE9Q0N7 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
4930426L09RikE9Q0N7 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
4930426L09RikE9Q0N7 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
4930426L09RikE9Q0N7 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
4930426L09RikE9Q0N7 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
4930426L09RikE9Q0N7 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
4930426L09RikE9Q0N7 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
4930426L09RikE9Q0N7 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
4930426L09RikE9Q0N7 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
4930426L09RikE9Q0N7 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
4930426L09RikE9Q0N7 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
4930426L09RikE9Q0N7 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
4930426L09RikE9Q0N7 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
4930426L09RikE9Q0N7 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
4930426L09RikE9Q0N7 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
4930426L09RikE9Q0N7 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
4930426L09RikE9Q0N7 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
4930426L09RikE9Q0N7 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
4930426L09RikE9Q0N7 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
4930426L09RikE9Q0N7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
4930426L09RikE9Q0N7 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
4930426L09RikE9Q0N7 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
4930426L09RikE9Q0N7 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
4930426L09RikE9Q0N7 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
4930426L09RikE9Q0N7 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
4930426L09RikE9Q0N7 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
4930426L09RikE9Q0N7 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
4930426L09RikE9Q0N7 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
4930426L09RikE9Q0N7 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
4930426L09RikE9Q0N7 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
4930426L09RikE9Q0N7 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
4930426L09RikE9Q0N7 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
4930426L09RikE9Q0N7 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
4930426L09RikE9Q0N7 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
4930426L09RikE9Q0N7 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
4930426L09RikE9Q0N7 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
4930426L09RikE9Q0N7 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
4930426L09RikE9Q0N7 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
4930426L09RikE9Q0N7 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
4930426L09RikE9Q0N7 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
4930426L09RikE9Q0N7 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
4930426L09RikE9Q0N7 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
4930426L09RikE9Q0N7 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
4930426L09RikE9Q0N7 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
4930426L09RikE9Q0N7 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
4930426L09RikE9Q0N7 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
4930426L09RikE9Q0N7 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
4930426L09RikE9Q0N7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
4930426L09RikE9Q0N7 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
4930426L09RikE9Q0N7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
4930426L09RikE9Q0N7 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
4930426L09RikE9Q0N7 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
4930426L09RikE9Q0N7 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
4930426L09RikE9Q0N7 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
4930426L09RikE9Q0N7 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
4930426L09RikE9Q0N7 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
4930426L09RikE9Q0N7 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
4930426L09RikE9Q0N7 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
4930426L09RikE9Q0N7 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
4930426L09RikE9Q0N7 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
4930426L09RikE9Q0N7 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
4930426L09RikE9Q0N7 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
4930426L09RikE9Q0N7 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
4930426L09RikE9Q0N7 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
4930426L09RikE9Q0N7 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
4930426L09RikE9Q0N7 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
4930426L09RikE9Q0N7 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
4930426L09RikE9Q0N7 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
4930426L09RikE9Q0N7 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
4930426L09RikE9Q0N7 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
4930426L09RikE9Q0N7 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
4930426L09RikE9Q0N7 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
4930426L09RikE9Q0N7 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
4930426L09RikE9Q0N7 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
4930426L09RikE9Q0N7 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
4930426L09RikE9Q0N7 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
4930426L09RikE9Q0N7 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
4930426L09RikE9Q0N7 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
4930426L09RikE9Q0N7 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
4930426L09RikE9Q0N7 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
4930426L09RikE9Q0N7 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
4930426L09RikE9Q0N7 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
4930426L09RikE9Q0N7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
4930426L09RikE9Q0N7 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
4930426L09RikE9Q0N7 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
4930426L09RikE9Q0N7 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
4930426L09RikE9Q0N7 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms