Protein–RNA interactions for Protein: E9PZM7

Scaf11, SR-related CTD-associated factor 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf11E9PZM7 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Scaf11E9PZM7 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Scaf11E9PZM7 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Scaf11E9PZM7 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Scaf11E9PZM7 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Scaf11E9PZM7 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Scaf11E9PZM7 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Scaf11E9PZM7 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Scaf11E9PZM7 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Scaf11E9PZM7 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Scaf11E9PZM7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Scaf11E9PZM7 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Scaf11E9PZM7 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Scaf11E9PZM7 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Scaf11E9PZM7 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Scaf11E9PZM7 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Scaf11E9PZM7 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Scaf11E9PZM7 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Scaf11E9PZM7 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Scaf11E9PZM7 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Scaf11E9PZM7 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Scaf11E9PZM7 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Scaf11E9PZM7 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Scaf11E9PZM7 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Scaf11E9PZM7 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Scaf11E9PZM7 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Scaf11E9PZM7 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Scaf11E9PZM7 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Scaf11E9PZM7 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Scaf11E9PZM7 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Scaf11E9PZM7 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Scaf11E9PZM7 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Scaf11E9PZM7 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Scaf11E9PZM7 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Scaf11E9PZM7 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Scaf11E9PZM7 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Scaf11E9PZM7 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Scaf11E9PZM7 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Scaf11E9PZM7 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Scaf11E9PZM7 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Scaf11E9PZM7 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Scaf11E9PZM7 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Scaf11E9PZM7 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Scaf11E9PZM7 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Scaf11E9PZM7 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Scaf11E9PZM7 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Scaf11E9PZM7 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Scaf11E9PZM7 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Scaf11E9PZM7 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Scaf11E9PZM7 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Scaf11E9PZM7 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Scaf11E9PZM7 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Scaf11E9PZM7 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Scaf11E9PZM7 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Scaf11E9PZM7 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Scaf11E9PZM7 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Scaf11E9PZM7 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Scaf11E9PZM7 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Scaf11E9PZM7 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Scaf11E9PZM7 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Scaf11E9PZM7 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Scaf11E9PZM7 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Scaf11E9PZM7 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Scaf11E9PZM7 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Scaf11E9PZM7 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Scaf11E9PZM7 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Scaf11E9PZM7 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Scaf11E9PZM7 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Scaf11E9PZM7 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Scaf11E9PZM7 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Scaf11E9PZM7 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Scaf11E9PZM7 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Scaf11E9PZM7 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Scaf11E9PZM7 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Scaf11E9PZM7 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Scaf11E9PZM7 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Scaf11E9PZM7 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Scaf11E9PZM7 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Scaf11E9PZM7 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Scaf11E9PZM7 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Scaf11E9PZM7 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Scaf11E9PZM7 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Scaf11E9PZM7 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Scaf11E9PZM7 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Scaf11E9PZM7 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Scaf11E9PZM7 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Scaf11E9PZM7 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Scaf11E9PZM7 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Scaf11E9PZM7 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Scaf11E9PZM7 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Scaf11E9PZM7 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Scaf11E9PZM7 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Scaf11E9PZM7 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Scaf11E9PZM7 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Scaf11E9PZM7 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Scaf11E9PZM7 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Scaf11E9PZM7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Scaf11E9PZM7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Scaf11E9PZM7 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Scaf11E9PZM7 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms