Protein–RNA interactions for Protein: E0CXC6

4930558K02Rik, RIKEN cDNA 4930558K02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930558K02RikE0CXC6 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
4930558K02RikE0CXC6 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
4930558K02RikE0CXC6 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
4930558K02RikE0CXC6 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
4930558K02RikE0CXC6 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
4930558K02RikE0CXC6 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
4930558K02RikE0CXC6 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
4930558K02RikE0CXC6 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
4930558K02RikE0CXC6 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
4930558K02RikE0CXC6 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
4930558K02RikE0CXC6 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
4930558K02RikE0CXC6 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
4930558K02RikE0CXC6 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
4930558K02RikE0CXC6 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
4930558K02RikE0CXC6 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
4930558K02RikE0CXC6 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
4930558K02RikE0CXC6 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
4930558K02RikE0CXC6 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
4930558K02RikE0CXC6 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
4930558K02RikE0CXC6 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
4930558K02RikE0CXC6 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
4930558K02RikE0CXC6 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
4930558K02RikE0CXC6 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
4930558K02RikE0CXC6 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
4930558K02RikE0CXC6 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
4930558K02RikE0CXC6 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
4930558K02RikE0CXC6 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
4930558K02RikE0CXC6 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
4930558K02RikE0CXC6 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
4930558K02RikE0CXC6 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
4930558K02RikE0CXC6 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
4930558K02RikE0CXC6 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
4930558K02RikE0CXC6 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
4930558K02RikE0CXC6 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
4930558K02RikE0CXC6 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
4930558K02RikE0CXC6 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
4930558K02RikE0CXC6 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
4930558K02RikE0CXC6 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
4930558K02RikE0CXC6 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
4930558K02RikE0CXC6 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
4930558K02RikE0CXC6 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
4930558K02RikE0CXC6 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
4930558K02RikE0CXC6 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
4930558K02RikE0CXC6 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
4930558K02RikE0CXC6 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
4930558K02RikE0CXC6 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
4930558K02RikE0CXC6 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
4930558K02RikE0CXC6 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
4930558K02RikE0CXC6 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
4930558K02RikE0CXC6 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
4930558K02RikE0CXC6 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
4930558K02RikE0CXC6 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
4930558K02RikE0CXC6 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
4930558K02RikE0CXC6 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
4930558K02RikE0CXC6 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
4930558K02RikE0CXC6 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
4930558K02RikE0CXC6 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
4930558K02RikE0CXC6 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
4930558K02RikE0CXC6 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
4930558K02RikE0CXC6 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
4930558K02RikE0CXC6 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
4930558K02RikE0CXC6 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
4930558K02RikE0CXC6 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
4930558K02RikE0CXC6 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
4930558K02RikE0CXC6 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
4930558K02RikE0CXC6 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
4930558K02RikE0CXC6 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
4930558K02RikE0CXC6 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
4930558K02RikE0CXC6 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
4930558K02RikE0CXC6 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
4930558K02RikE0CXC6 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
4930558K02RikE0CXC6 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
4930558K02RikE0CXC6 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
4930558K02RikE0CXC6 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
4930558K02RikE0CXC6 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
4930558K02RikE0CXC6 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
4930558K02RikE0CXC6 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
4930558K02RikE0CXC6 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
4930558K02RikE0CXC6 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
4930558K02RikE0CXC6 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
4930558K02RikE0CXC6 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
4930558K02RikE0CXC6 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
4930558K02RikE0CXC6 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
4930558K02RikE0CXC6 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
4930558K02RikE0CXC6 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
4930558K02RikE0CXC6 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
4930558K02RikE0CXC6 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
4930558K02RikE0CXC6 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
4930558K02RikE0CXC6 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
4930558K02RikE0CXC6 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
4930558K02RikE0CXC6 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
4930558K02RikE0CXC6 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
4930558K02RikE0CXC6 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
4930558K02RikE0CXC6 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
4930558K02RikE0CXC6 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
4930558K02RikE0CXC6 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
4930558K02RikE0CXC6 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
4930558K02RikE0CXC6 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
4930558K02RikE0CXC6 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
4930558K02RikE0CXC6 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms