Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5T8

4930407I10Rik, RIKEN cDNA 4930407I10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 1,512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930407I10RikD3Z5T8 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
4930407I10RikD3Z5T8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
4930407I10RikD3Z5T8 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
4930407I10RikD3Z5T8 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
4930407I10RikD3Z5T8 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
4930407I10RikD3Z5T8 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
4930407I10RikD3Z5T8 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
4930407I10RikD3Z5T8 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
4930407I10RikD3Z5T8 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
4930407I10RikD3Z5T8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
4930407I10RikD3Z5T8 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
4930407I10RikD3Z5T8 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
4930407I10RikD3Z5T8 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
4930407I10RikD3Z5T8 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
4930407I10RikD3Z5T8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
4930407I10RikD3Z5T8 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
4930407I10RikD3Z5T8 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
4930407I10RikD3Z5T8 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
4930407I10RikD3Z5T8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
4930407I10RikD3Z5T8 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
4930407I10RikD3Z5T8 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
4930407I10RikD3Z5T8 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
4930407I10RikD3Z5T8 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
4930407I10RikD3Z5T8 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
4930407I10RikD3Z5T8 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
4930407I10RikD3Z5T8 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
4930407I10RikD3Z5T8 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
4930407I10RikD3Z5T8 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
4930407I10RikD3Z5T8 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
4930407I10RikD3Z5T8 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
4930407I10RikD3Z5T8 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
4930407I10RikD3Z5T8 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
4930407I10RikD3Z5T8 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
4930407I10RikD3Z5T8 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
4930407I10RikD3Z5T8 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
4930407I10RikD3Z5T8 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
4930407I10RikD3Z5T8 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
4930407I10RikD3Z5T8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
4930407I10RikD3Z5T8 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
4930407I10RikD3Z5T8 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
4930407I10RikD3Z5T8 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
4930407I10RikD3Z5T8 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
4930407I10RikD3Z5T8 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
4930407I10RikD3Z5T8 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
4930407I10RikD3Z5T8 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
4930407I10RikD3Z5T8 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
4930407I10RikD3Z5T8 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
4930407I10RikD3Z5T8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
4930407I10RikD3Z5T8 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
4930407I10RikD3Z5T8 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
4930407I10RikD3Z5T8 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
4930407I10RikD3Z5T8 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
4930407I10RikD3Z5T8 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
4930407I10RikD3Z5T8 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
4930407I10RikD3Z5T8 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
4930407I10RikD3Z5T8 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
4930407I10RikD3Z5T8 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
4930407I10RikD3Z5T8 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
4930407I10RikD3Z5T8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
4930407I10RikD3Z5T8 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
4930407I10RikD3Z5T8 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
4930407I10RikD3Z5T8 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
4930407I10RikD3Z5T8 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
4930407I10RikD3Z5T8 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
4930407I10RikD3Z5T8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
4930407I10RikD3Z5T8 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
4930407I10RikD3Z5T8 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
4930407I10RikD3Z5T8 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
4930407I10RikD3Z5T8 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
4930407I10RikD3Z5T8 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
4930407I10RikD3Z5T8 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
4930407I10RikD3Z5T8 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
4930407I10RikD3Z5T8 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
4930407I10RikD3Z5T8 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
4930407I10RikD3Z5T8 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
4930407I10RikD3Z5T8 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
4930407I10RikD3Z5T8 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
4930407I10RikD3Z5T8 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
4930407I10RikD3Z5T8 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
4930407I10RikD3Z5T8 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
4930407I10RikD3Z5T8 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
4930407I10RikD3Z5T8 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
4930407I10RikD3Z5T8 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
4930407I10RikD3Z5T8 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
4930407I10RikD3Z5T8 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
4930407I10RikD3Z5T8 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
4930407I10RikD3Z5T8 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
4930407I10RikD3Z5T8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
4930407I10RikD3Z5T8 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
4930407I10RikD3Z5T8 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
4930407I10RikD3Z5T8 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
4930407I10RikD3Z5T8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
4930407I10RikD3Z5T8 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
4930407I10RikD3Z5T8 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
4930407I10RikD3Z5T8 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
4930407I10RikD3Z5T8 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
4930407I10RikD3Z5T8 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
4930407I10RikD3Z5T8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
4930407I10RikD3Z5T8 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
4930407I10RikD3Z5T8 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms