Protein–RNA interactions for Protein: C0HKD9

Mfap1b, Microfibrillar-associated protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfap1bC0HKD9 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Mfap1bC0HKD9 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Mfap1bC0HKD9 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Mfap1bC0HKD9 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Mfap1bC0HKD9 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Mfap1bC0HKD9 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Mfap1bC0HKD9 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Mfap1bC0HKD9 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Mfap1bC0HKD9 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Mfap1bC0HKD9 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Mfap1bC0HKD9 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Mfap1bC0HKD9 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Mfap1bC0HKD9 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Mfap1bC0HKD9 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Mfap1bC0HKD9 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Mfap1bC0HKD9 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Mfap1bC0HKD9 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Mfap1bC0HKD9 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Mfap1bC0HKD9 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Mfap1bC0HKD9 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Mfap1bC0HKD9 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Mfap1bC0HKD9 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Mfap1bC0HKD9 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Mfap1bC0HKD9 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Mfap1bC0HKD9 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Mfap1bC0HKD9 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Mfap1bC0HKD9 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Mfap1bC0HKD9 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Mfap1bC0HKD9 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Mfap1bC0HKD9 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Mfap1bC0HKD9 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Mfap1bC0HKD9 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Mfap1bC0HKD9 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Mfap1bC0HKD9 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Mfap1bC0HKD9 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Mfap1bC0HKD9 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Mfap1bC0HKD9 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Mfap1bC0HKD9 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Mfap1bC0HKD9 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Mfap1bC0HKD9 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Mfap1bC0HKD9 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Mfap1bC0HKD9 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Mfap1bC0HKD9 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Mfap1bC0HKD9 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Mfap1bC0HKD9 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Mfap1bC0HKD9 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Mfap1bC0HKD9 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Mfap1bC0HKD9 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Mfap1bC0HKD9 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Mfap1bC0HKD9 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Mfap1bC0HKD9 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Mfap1bC0HKD9 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Mfap1bC0HKD9 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Mfap1bC0HKD9 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Mfap1bC0HKD9 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Mfap1bC0HKD9 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Mfap1bC0HKD9 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Mfap1bC0HKD9 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Mfap1bC0HKD9 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Mfap1bC0HKD9 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Mfap1bC0HKD9 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Mfap1bC0HKD9 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Mfap1bC0HKD9 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Mfap1bC0HKD9 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Mfap1bC0HKD9 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Mfap1bC0HKD9 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Mfap1bC0HKD9 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Mfap1bC0HKD9 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Mfap1bC0HKD9 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mfap1bC0HKD9 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mfap1bC0HKD9 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mfap1bC0HKD9 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mfap1bC0HKD9 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mfap1bC0HKD9 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mfap1bC0HKD9 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Mfap1bC0HKD9 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Mfap1bC0HKD9 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Mfap1bC0HKD9 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Mfap1bC0HKD9 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Mfap1bC0HKD9 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mfap1bC0HKD9 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mfap1bC0HKD9 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mfap1bC0HKD9 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mfap1bC0HKD9 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mfap1bC0HKD9 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mfap1bC0HKD9 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mfap1bC0HKD9 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mfap1bC0HKD9 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mfap1bC0HKD9 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mfap1bC0HKD9 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mfap1bC0HKD9 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mfap1bC0HKD9 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mfap1bC0HKD9 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mfap1bC0HKD9 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Mfap1bC0HKD9 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Mfap1bC0HKD9 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Mfap1bC0HKD9 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Mfap1bC0HKD9 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Mfap1bC0HKD9 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Mfap1bC0HKD9 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms