Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Phf11bB4XVQ1 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Phf11bB4XVQ1 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Phf11bB4XVQ1 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Phf11bB4XVQ1 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Phf11bB4XVQ1 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Phf11bB4XVQ1 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Phf11bB4XVQ1 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Phf11bB4XVQ1 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Phf11bB4XVQ1 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Phf11bB4XVQ1 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Phf11bB4XVQ1 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Phf11bB4XVQ1 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Phf11bB4XVQ1 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Phf11bB4XVQ1 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Phf11bB4XVQ1 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Phf11bB4XVQ1 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Phf11bB4XVQ1 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Phf11bB4XVQ1 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Phf11bB4XVQ1 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Phf11bB4XVQ1 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Phf11bB4XVQ1 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Phf11bB4XVQ1 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Phf11bB4XVQ1 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Phf11bB4XVQ1 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Phf11bB4XVQ1 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Phf11bB4XVQ1 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Phf11bB4XVQ1 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Phf11bB4XVQ1 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Phf11bB4XVQ1 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Phf11bB4XVQ1 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Phf11bB4XVQ1 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Phf11bB4XVQ1 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Phf11bB4XVQ1 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Phf11bB4XVQ1 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Phf11bB4XVQ1 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Phf11bB4XVQ1 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Phf11bB4XVQ1 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Phf11bB4XVQ1 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Phf11bB4XVQ1 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Phf11bB4XVQ1 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Phf11bB4XVQ1 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Phf11bB4XVQ1 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Phf11bB4XVQ1 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Phf11bB4XVQ1 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Phf11bB4XVQ1 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Phf11bB4XVQ1 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Phf11bB4XVQ1 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Phf11bB4XVQ1 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Phf11bB4XVQ1 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Phf11bB4XVQ1 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Phf11bB4XVQ1 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Phf11bB4XVQ1 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Phf11bB4XVQ1 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Phf11bB4XVQ1 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Phf11bB4XVQ1 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Phf11bB4XVQ1 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Phf11bB4XVQ1 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Phf11bB4XVQ1 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Phf11bB4XVQ1 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Phf11bB4XVQ1 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Phf11bB4XVQ1 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Phf11bB4XVQ1 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Phf11bB4XVQ1 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Phf11bB4XVQ1 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Phf11bB4XVQ1 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Phf11bB4XVQ1 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Phf11bB4XVQ1 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Phf11bB4XVQ1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Phf11bB4XVQ1 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Phf11bB4XVQ1 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Phf11bB4XVQ1 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Phf11bB4XVQ1 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Phf11bB4XVQ1 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Phf11bB4XVQ1 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Phf11bB4XVQ1 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Phf11bB4XVQ1 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Phf11bB4XVQ1 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Phf11bB4XVQ1 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Phf11bB4XVQ1 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Phf11bB4XVQ1 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Phf11bB4XVQ1 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Phf11bB4XVQ1 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Phf11bB4XVQ1 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Phf11bB4XVQ1 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Phf11bB4XVQ1 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Phf11bB4XVQ1 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Phf11bB4XVQ1 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Phf11bB4XVQ1 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Phf11bB4XVQ1 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Phf11bB4XVQ1 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Phf11bB4XVQ1 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Phf11bB4XVQ1 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Phf11bB4XVQ1 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Phf11bB4XVQ1 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Phf11bB4XVQ1 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Phf11bB4XVQ1 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Phf11bB4XVQ1 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Phf11bB4XVQ1 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Phf11bB4XVQ1 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms