Protein–RNA interactions for Protein: B2RW11

Ankrd34a, Ankyrin repeat domain 34A, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd34aB2RW11 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ankrd34aB2RW11 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ankrd34aB2RW11 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ankrd34aB2RW11 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ankrd34aB2RW11 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ankrd34aB2RW11 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Ankrd34aB2RW11 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Ankrd34aB2RW11 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ankrd34aB2RW11 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ankrd34aB2RW11 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ankrd34aB2RW11 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ankrd34aB2RW11 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ankrd34aB2RW11 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ankrd34aB2RW11 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ankrd34aB2RW11 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ankrd34aB2RW11 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ankrd34aB2RW11 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ankrd34aB2RW11 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ankrd34aB2RW11 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ankrd34aB2RW11 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ankrd34aB2RW11 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ankrd34aB2RW11 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ankrd34aB2RW11 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ankrd34aB2RW11 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ankrd34aB2RW11 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Ankrd34aB2RW11 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ankrd34aB2RW11 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ankrd34aB2RW11 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ankrd34aB2RW11 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ankrd34aB2RW11 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ankrd34aB2RW11 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ankrd34aB2RW11 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ankrd34aB2RW11 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ankrd34aB2RW11 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ankrd34aB2RW11 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ankrd34aB2RW11 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ankrd34aB2RW11 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ankrd34aB2RW11 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ankrd34aB2RW11 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ankrd34aB2RW11 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ankrd34aB2RW11 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Ankrd34aB2RW11 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ankrd34aB2RW11 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Ankrd34aB2RW11 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ankrd34aB2RW11 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ankrd34aB2RW11 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ankrd34aB2RW11 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ankrd34aB2RW11 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ankrd34aB2RW11 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ankrd34aB2RW11 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ankrd34aB2RW11 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Ankrd34aB2RW11 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ankrd34aB2RW11 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ankrd34aB2RW11 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ankrd34aB2RW11 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ankrd34aB2RW11 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ankrd34aB2RW11 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Ankrd34aB2RW11 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ankrd34aB2RW11 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ankrd34aB2RW11 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ankrd34aB2RW11 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ankrd34aB2RW11 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ankrd34aB2RW11 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ankrd34aB2RW11 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ankrd34aB2RW11 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ankrd34aB2RW11 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ankrd34aB2RW11 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ankrd34aB2RW11 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ankrd34aB2RW11 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ankrd34aB2RW11 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ankrd34aB2RW11 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ankrd34aB2RW11 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ankrd34aB2RW11 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ankrd34aB2RW11 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ankrd34aB2RW11 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ankrd34aB2RW11 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ankrd34aB2RW11 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ankrd34aB2RW11 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ankrd34aB2RW11 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Ankrd34aB2RW11 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ankrd34aB2RW11 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ankrd34aB2RW11 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ankrd34aB2RW11 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ankrd34aB2RW11 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ankrd34aB2RW11 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ankrd34aB2RW11 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ankrd34aB2RW11 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ankrd34aB2RW11 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ankrd34aB2RW11 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ankrd34aB2RW11 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Ankrd34aB2RW11 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Ankrd34aB2RW11 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ankrd34aB2RW11 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Ankrd34aB2RW11 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ankrd34aB2RW11 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ankrd34aB2RW11 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ankrd34aB2RW11 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ankrd34aB2RW11 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ankrd34aB2RW11 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ankrd34aB2RW11 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms