Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

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Length 902 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Prrt4B2RU40 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Prrt4B2RU40 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Prrt4B2RU40 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Prrt4B2RU40 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Prrt4B2RU40 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Prrt4B2RU40 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Prrt4B2RU40 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Prrt4B2RU40 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Prrt4B2RU40 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Prrt4B2RU40 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Prrt4B2RU40 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Prrt4B2RU40 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Prrt4B2RU40 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Prrt4B2RU40 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Prrt4B2RU40 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Prrt4B2RU40 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Prrt4B2RU40 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Prrt4B2RU40 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Prrt4B2RU40 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Prrt4B2RU40 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Prrt4B2RU40 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Prrt4B2RU40 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Prrt4B2RU40 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Prrt4B2RU40 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Prrt4B2RU40 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Prrt4B2RU40 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Prrt4B2RU40 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Prrt4B2RU40 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Prrt4B2RU40 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Prrt4B2RU40 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Prrt4B2RU40 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Prrt4B2RU40 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Prrt4B2RU40 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Prrt4B2RU40 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Prrt4B2RU40 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Prrt4B2RU40 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Prrt4B2RU40 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Prrt4B2RU40 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Prrt4B2RU40 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Prrt4B2RU40 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Prrt4B2RU40 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Prrt4B2RU40 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Prrt4B2RU40 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Prrt4B2RU40 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Prrt4B2RU40 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Prrt4B2RU40 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Prrt4B2RU40 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Prrt4B2RU40 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Prrt4B2RU40 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Prrt4B2RU40 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Prrt4B2RU40 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Prrt4B2RU40 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Prrt4B2RU40 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Prrt4B2RU40 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Prrt4B2RU40 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Prrt4B2RU40 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Prrt4B2RU40 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Prrt4B2RU40 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Prrt4B2RU40 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Prrt4B2RU40 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Prrt4B2RU40 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Prrt4B2RU40 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Prrt4B2RU40 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Prrt4B2RU40 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Prrt4B2RU40 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Prrt4B2RU40 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Prrt4B2RU40 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Prrt4B2RU40 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Prrt4B2RU40 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Prrt4B2RU40 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Prrt4B2RU40 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Prrt4B2RU40 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Prrt4B2RU40 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Prrt4B2RU40 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Prrt4B2RU40 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Prrt4B2RU40 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Prrt4B2RU40 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Prrt4B2RU40 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Prrt4B2RU40 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Prrt4B2RU40 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Prrt4B2RU40 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Prrt4B2RU40 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Prrt4B2RU40 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Prrt4B2RU40 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Prrt4B2RU40 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Prrt4B2RU40 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Prrt4B2RU40 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Prrt4B2RU40 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Prrt4B2RU40 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Prrt4B2RU40 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Prrt4B2RU40 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Prrt4B2RU40 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Prrt4B2RU40 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Prrt4B2RU40 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Prrt4B2RU40 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Prrt4B2RU40 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Prrt4B2RU40 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prrt4B2RU40 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prrt4B2RU40 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms