Protein–RNA interactions for Protein: B2RTN3

Zscan5b, Zinc finger and SCAN domain-containing 5B, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan5bB2RTN3 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zscan5bB2RTN3 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zscan5bB2RTN3 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zscan5bB2RTN3 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zscan5bB2RTN3 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zscan5bB2RTN3 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zscan5bB2RTN3 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zscan5bB2RTN3 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zscan5bB2RTN3 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zscan5bB2RTN3 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zscan5bB2RTN3 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Zscan5bB2RTN3 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zscan5bB2RTN3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zscan5bB2RTN3 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zscan5bB2RTN3 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zscan5bB2RTN3 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zscan5bB2RTN3 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zscan5bB2RTN3 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zscan5bB2RTN3 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zscan5bB2RTN3 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zscan5bB2RTN3 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zscan5bB2RTN3 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zscan5bB2RTN3 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zscan5bB2RTN3 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zscan5bB2RTN3 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zscan5bB2RTN3 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zscan5bB2RTN3 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zscan5bB2RTN3 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zscan5bB2RTN3 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zscan5bB2RTN3 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zscan5bB2RTN3 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zscan5bB2RTN3 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zscan5bB2RTN3 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zscan5bB2RTN3 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Zscan5bB2RTN3 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Zscan5bB2RTN3 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Zscan5bB2RTN3 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Zscan5bB2RTN3 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Zscan5bB2RTN3 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Zscan5bB2RTN3 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Zscan5bB2RTN3 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Zscan5bB2RTN3 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Zscan5bB2RTN3 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Zscan5bB2RTN3 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Zscan5bB2RTN3 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Zscan5bB2RTN3 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Zscan5bB2RTN3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Zscan5bB2RTN3 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Zscan5bB2RTN3 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Zscan5bB2RTN3 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Zscan5bB2RTN3 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Zscan5bB2RTN3 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Zscan5bB2RTN3 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Zscan5bB2RTN3 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Zscan5bB2RTN3 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Zscan5bB2RTN3 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Zscan5bB2RTN3 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Zscan5bB2RTN3 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Zscan5bB2RTN3 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Zscan5bB2RTN3 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Zscan5bB2RTN3 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Zscan5bB2RTN3 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Zscan5bB2RTN3 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Zscan5bB2RTN3 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Zscan5bB2RTN3 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Zscan5bB2RTN3 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Zscan5bB2RTN3 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Zscan5bB2RTN3 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Zscan5bB2RTN3 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Zscan5bB2RTN3 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Zscan5bB2RTN3 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Zscan5bB2RTN3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Zscan5bB2RTN3 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Zscan5bB2RTN3 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Zscan5bB2RTN3 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Zscan5bB2RTN3 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Zscan5bB2RTN3 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Zscan5bB2RTN3 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Zscan5bB2RTN3 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Zscan5bB2RTN3 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Zscan5bB2RTN3 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Zscan5bB2RTN3 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Zscan5bB2RTN3 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Zscan5bB2RTN3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Zscan5bB2RTN3 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Zscan5bB2RTN3 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Zscan5bB2RTN3 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Zscan5bB2RTN3 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Zscan5bB2RTN3 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Zscan5bB2RTN3 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Zscan5bB2RTN3 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Zscan5bB2RTN3 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Zscan5bB2RTN3 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Zscan5bB2RTN3 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Zscan5bB2RTN3 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Zscan5bB2RTN3 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Zscan5bB2RTN3 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Zscan5bB2RTN3 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Zscan5bB2RTN3 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Zscan5bB2RTN3 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms