Protein–RNA interactions for Protein: A7TZF0

Skint3, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint3A7TZF0 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Skint3A7TZF0 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Skint3A7TZF0 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Skint3A7TZF0 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Skint3A7TZF0 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Skint3A7TZF0 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Skint3A7TZF0 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Skint3A7TZF0 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Skint3A7TZF0 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Skint3A7TZF0 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Skint3A7TZF0 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Skint3A7TZF0 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Skint3A7TZF0 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Skint3A7TZF0 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Skint3A7TZF0 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Skint3A7TZF0 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Skint3A7TZF0 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Skint3A7TZF0 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Skint3A7TZF0 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Skint3A7TZF0 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Skint3A7TZF0 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Skint3A7TZF0 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Skint3A7TZF0 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Skint3A7TZF0 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Skint3A7TZF0 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Skint3A7TZF0 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Skint3A7TZF0 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Skint3A7TZF0 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Skint3A7TZF0 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Skint3A7TZF0 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Skint3A7TZF0 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Skint3A7TZF0 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Skint3A7TZF0 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Skint3A7TZF0 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Skint3A7TZF0 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Skint3A7TZF0 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Skint3A7TZF0 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Skint3A7TZF0 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Skint3A7TZF0 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Skint3A7TZF0 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Skint3A7TZF0 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Skint3A7TZF0 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Skint3A7TZF0 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Skint3A7TZF0 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Skint3A7TZF0 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Skint3A7TZF0 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Skint3A7TZF0 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Skint3A7TZF0 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Skint3A7TZF0 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Skint3A7TZF0 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Skint3A7TZF0 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Skint3A7TZF0 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Skint3A7TZF0 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Skint3A7TZF0 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Skint3A7TZF0 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Skint3A7TZF0 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Skint3A7TZF0 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Skint3A7TZF0 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Skint3A7TZF0 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Skint3A7TZF0 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Skint3A7TZF0 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Skint3A7TZF0 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Skint3A7TZF0 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Skint3A7TZF0 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Skint3A7TZF0 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Skint3A7TZF0 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Skint3A7TZF0 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Skint3A7TZF0 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Skint3A7TZF0 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Skint3A7TZF0 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Skint3A7TZF0 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Skint3A7TZF0 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Skint3A7TZF0 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Skint3A7TZF0 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Skint3A7TZF0 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Skint3A7TZF0 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Skint3A7TZF0 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Skint3A7TZF0 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Skint3A7TZF0 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Skint3A7TZF0 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Skint3A7TZF0 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Skint3A7TZF0 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Skint3A7TZF0 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Skint3A7TZF0 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Skint3A7TZF0 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Skint3A7TZF0 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Skint3A7TZF0 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Skint3A7TZF0 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Skint3A7TZF0 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Skint3A7TZF0 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Skint3A7TZF0 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Skint3A7TZF0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Skint3A7TZF0 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Skint3A7TZF0 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Skint3A7TZF0 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Skint3A7TZF0 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Skint3A7TZF0 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Skint3A7TZF0 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Skint3A7TZF0 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Skint3A7TZF0 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms