Protein–RNA interactions for Protein: A7L9Z8

Atp2c2, Calcium-transporting ATPase type 2C member 2, mousemouse

Predictions only

Length 944 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2c2A7L9Z8 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atp2c2A7L9Z8 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atp2c2A7L9Z8 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atp2c2A7L9Z8 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atp2c2A7L9Z8 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atp2c2A7L9Z8 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atp2c2A7L9Z8 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atp2c2A7L9Z8 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atp2c2A7L9Z8 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atp2c2A7L9Z8 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atp2c2A7L9Z8 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atp2c2A7L9Z8 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atp2c2A7L9Z8 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atp2c2A7L9Z8 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atp2c2A7L9Z8 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atp2c2A7L9Z8 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atp2c2A7L9Z8 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atp2c2A7L9Z8 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atp2c2A7L9Z8 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atp2c2A7L9Z8 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Atp2c2A7L9Z8 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atp2c2A7L9Z8 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atp2c2A7L9Z8 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atp2c2A7L9Z8 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atp2c2A7L9Z8 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atp2c2A7L9Z8 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atp2c2A7L9Z8 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atp2c2A7L9Z8 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atp2c2A7L9Z8 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atp2c2A7L9Z8 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atp2c2A7L9Z8 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atp2c2A7L9Z8 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atp2c2A7L9Z8 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atp2c2A7L9Z8 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Atp2c2A7L9Z8 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atp2c2A7L9Z8 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atp2c2A7L9Z8 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atp2c2A7L9Z8 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atp2c2A7L9Z8 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atp2c2A7L9Z8 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atp2c2A7L9Z8 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atp2c2A7L9Z8 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atp2c2A7L9Z8 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atp2c2A7L9Z8 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atp2c2A7L9Z8 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atp2c2A7L9Z8 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atp2c2A7L9Z8 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atp2c2A7L9Z8 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atp2c2A7L9Z8 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atp2c2A7L9Z8 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Atp2c2A7L9Z8 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Atp2c2A7L9Z8 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Atp2c2A7L9Z8 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Atp2c2A7L9Z8 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Atp2c2A7L9Z8 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Atp2c2A7L9Z8 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Atp2c2A7L9Z8 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Atp2c2A7L9Z8 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Atp2c2A7L9Z8 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Atp2c2A7L9Z8 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atp2c2A7L9Z8 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atp2c2A7L9Z8 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atp2c2A7L9Z8 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Atp2c2A7L9Z8 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atp2c2A7L9Z8 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atp2c2A7L9Z8 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atp2c2A7L9Z8 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atp2c2A7L9Z8 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atp2c2A7L9Z8 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atp2c2A7L9Z8 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atp2c2A7L9Z8 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atp2c2A7L9Z8 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atp2c2A7L9Z8 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atp2c2A7L9Z8 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atp2c2A7L9Z8 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atp2c2A7L9Z8 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atp2c2A7L9Z8 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atp2c2A7L9Z8 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atp2c2A7L9Z8 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atp2c2A7L9Z8 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atp2c2A7L9Z8 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atp2c2A7L9Z8 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atp2c2A7L9Z8 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atp2c2A7L9Z8 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atp2c2A7L9Z8 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atp2c2A7L9Z8 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atp2c2A7L9Z8 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atp2c2A7L9Z8 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atp2c2A7L9Z8 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atp2c2A7L9Z8 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atp2c2A7L9Z8 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atp2c2A7L9Z8 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atp2c2A7L9Z8 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Atp2c2A7L9Z8 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atp2c2A7L9Z8 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atp2c2A7L9Z8 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atp2c2A7L9Z8 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atp2c2A7L9Z8 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atp2c2A7L9Z8 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Atp2c2A7L9Z8 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms