Protein–RNA interactions for Protein: A0JLY1

Ccdc173, Coiled-coil domain-containing protein 173, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc173A0JLY1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc173A0JLY1 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc173A0JLY1 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc173A0JLY1 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc173A0JLY1 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc173A0JLY1 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc173A0JLY1 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc173A0JLY1 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc173A0JLY1 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc173A0JLY1 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc173A0JLY1 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc173A0JLY1 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc173A0JLY1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc173A0JLY1 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc173A0JLY1 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc173A0JLY1 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc173A0JLY1 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc173A0JLY1 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc173A0JLY1 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc173A0JLY1 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc173A0JLY1 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc173A0JLY1 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc173A0JLY1 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc173A0JLY1 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc173A0JLY1 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc173A0JLY1 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc173A0JLY1 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc173A0JLY1 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc173A0JLY1 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc173A0JLY1 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc173A0JLY1 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc173A0JLY1 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc173A0JLY1 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc173A0JLY1 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc173A0JLY1 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc173A0JLY1 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc173A0JLY1 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc173A0JLY1 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc173A0JLY1 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc173A0JLY1 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc173A0JLY1 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc173A0JLY1 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc173A0JLY1 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc173A0JLY1 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc173A0JLY1 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc173A0JLY1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc173A0JLY1 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc173A0JLY1 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc173A0JLY1 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc173A0JLY1 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc173A0JLY1 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc173A0JLY1 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc173A0JLY1 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc173A0JLY1 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc173A0JLY1 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc173A0JLY1 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc173A0JLY1 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc173A0JLY1 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc173A0JLY1 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc173A0JLY1 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc173A0JLY1 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc173A0JLY1 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc173A0JLY1 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc173A0JLY1 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc173A0JLY1 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc173A0JLY1 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc173A0JLY1 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc173A0JLY1 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc173A0JLY1 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc173A0JLY1 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc173A0JLY1 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc173A0JLY1 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc173A0JLY1 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc173A0JLY1 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc173A0JLY1 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc173A0JLY1 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc173A0JLY1 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc173A0JLY1 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc173A0JLY1 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc173A0JLY1 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc173A0JLY1 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc173A0JLY1 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc173A0JLY1 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc173A0JLY1 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc173A0JLY1 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc173A0JLY1 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc173A0JLY1 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc173A0JLY1 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc173A0JLY1 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc173A0JLY1 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc173A0JLY1 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc173A0JLY1 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc173A0JLY1 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc173A0JLY1 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc173A0JLY1 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc173A0JLY1 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc173A0JLY1 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc173A0JLY1 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc173A0JLY1 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc173A0JLY1 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms