Protein–RNA interactions for Protein: A0A0M3U1B0

Sycp2l, Synaptonemal complex protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp2lA0A0M3U1B0 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sycp2lA0A0M3U1B0 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sycp2lA0A0M3U1B0 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sycp2lA0A0M3U1B0 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sycp2lA0A0M3U1B0 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sycp2lA0A0M3U1B0 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sycp2lA0A0M3U1B0 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sycp2lA0A0M3U1B0 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sycp2lA0A0M3U1B0 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sycp2lA0A0M3U1B0 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sycp2lA0A0M3U1B0 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Sycp2lA0A0M3U1B0 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sycp2lA0A0M3U1B0 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sycp2lA0A0M3U1B0 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sycp2lA0A0M3U1B0 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sycp2lA0A0M3U1B0 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sycp2lA0A0M3U1B0 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sycp2lA0A0M3U1B0 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Sycp2lA0A0M3U1B0 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sycp2lA0A0M3U1B0 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Sycp2lA0A0M3U1B0 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sycp2lA0A0M3U1B0 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sycp2lA0A0M3U1B0 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sycp2lA0A0M3U1B0 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sycp2lA0A0M3U1B0 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sycp2lA0A0M3U1B0 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sycp2lA0A0M3U1B0 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sycp2lA0A0M3U1B0 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sycp2lA0A0M3U1B0 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sycp2lA0A0M3U1B0 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sycp2lA0A0M3U1B0 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sycp2lA0A0M3U1B0 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sycp2lA0A0M3U1B0 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sycp2lA0A0M3U1B0 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sycp2lA0A0M3U1B0 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sycp2lA0A0M3U1B0 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sycp2lA0A0M3U1B0 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sycp2lA0A0M3U1B0 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sycp2lA0A0M3U1B0 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sycp2lA0A0M3U1B0 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sycp2lA0A0M3U1B0 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sycp2lA0A0M3U1B0 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sycp2lA0A0M3U1B0 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sycp2lA0A0M3U1B0 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sycp2lA0A0M3U1B0 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sycp2lA0A0M3U1B0 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sycp2lA0A0M3U1B0 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sycp2lA0A0M3U1B0 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sycp2lA0A0M3U1B0 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sycp2lA0A0M3U1B0 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sycp2lA0A0M3U1B0 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sycp2lA0A0M3U1B0 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sycp2lA0A0M3U1B0 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sycp2lA0A0M3U1B0 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sycp2lA0A0M3U1B0 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sycp2lA0A0M3U1B0 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sycp2lA0A0M3U1B0 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sycp2lA0A0M3U1B0 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sycp2lA0A0M3U1B0 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sycp2lA0A0M3U1B0 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sycp2lA0A0M3U1B0 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sycp2lA0A0M3U1B0 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sycp2lA0A0M3U1B0 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sycp2lA0A0M3U1B0 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Sycp2lA0A0M3U1B0 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sycp2lA0A0M3U1B0 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sycp2lA0A0M3U1B0 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sycp2lA0A0M3U1B0 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sycp2lA0A0M3U1B0 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sycp2lA0A0M3U1B0 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sycp2lA0A0M3U1B0 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sycp2lA0A0M3U1B0 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sycp2lA0A0M3U1B0 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sycp2lA0A0M3U1B0 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sycp2lA0A0M3U1B0 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sycp2lA0A0M3U1B0 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sycp2lA0A0M3U1B0 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sycp2lA0A0M3U1B0 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sycp2lA0A0M3U1B0 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sycp2lA0A0M3U1B0 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sycp2lA0A0M3U1B0 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sycp2lA0A0M3U1B0 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sycp2lA0A0M3U1B0 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sycp2lA0A0M3U1B0 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sycp2lA0A0M3U1B0 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sycp2lA0A0M3U1B0 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sycp2lA0A0M3U1B0 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms