Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 Gm7833-201ENSMUST00000183288 990 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Ciao1Q99KN2 Gm29617-201ENSMUST00000185730 610 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Ciao1Q99KN2 Gm29689-201ENSMUST00000221076 589 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Ciao1Q99KN2 Gm43305-202ENSMUST00000225083 705 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Ciao1Q99KN2 AC119177.2-201ENSMUST00000226699 629 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Ciao1Q99KN2 Ensa-202ENSMUST00000058230 1130 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Ciao1Q99KN2 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ciao1Q99KN2 Gm10603-201ENSMUST00000183512 2279 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ciao1Q99KN2 Cckar-202ENSMUST00000200691 3230 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ciao1Q99KN2 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ciao1Q99KN2 1700110I01Rik-202ENSMUST00000112812 1737 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ciao1Q99KN2 Ttll7-203ENSMUST00000106134 2664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ciao1Q99KN2 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ciao1Q99KN2 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ciao1Q99KN2 Ncam1-201ENSMUST00000114476 2567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ciao1Q99KN2 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ciao1Q99KN2 Arih2-201ENSMUST00000013338 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ciao1Q99KN2 Gm45234-201ENSMUST00000129411 4359 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ciao1Q99KN2 Pex26-203ENSMUST00000120066 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ciao1Q99KN2 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Ciao1Q99KN2 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ciao1Q99KN2 Pcgf5-202ENSMUST00000071267 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ciao1Q99KN2 Hk3-201ENSMUST00000052949 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Ciao1Q99KN2 Gm12381-201ENSMUST00000126314 2186 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ciao1Q99KN2 Itpa-201ENSMUST00000103193 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ciao1Q99KN2 D030068K23Rik-203ENSMUST00000181098 1399 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
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Ciao1Q99KN2 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ciao1Q99KN2 Cyp2d9-201ENSMUST00000089129 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ciao1Q99KN2 Aplp2-202ENSMUST00000079758 3504 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ciao1Q99KN2 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
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Ciao1Q99KN2 Snrnp27-201ENSMUST00000001186 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
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Ciao1Q99KN2 Rbm48-202ENSMUST00000121877 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
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Ciao1Q99KN2 Gm14817-201ENSMUST00000148522 643 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
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Ciao1Q99KN2 Zfp637-210ENSMUST00000164472 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
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Ciao1Q99KN2 Specc1-214ENSMUST00000202389 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ciao1Q99KN2 Dkk2-201ENSMUST00000029665 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
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Ciao1Q99KN2 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ciao1Q99KN2 2810471M01Rik-201ENSMUST00000146554 1597 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
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Ciao1Q99KN2 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
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Ciao1Q99KN2 Sf3a3-201ENSMUST00000030734 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ciao1Q99KN2 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ciao1Q99KN2 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ciao1Q99KN2 Enthd1-201ENSMUST00000096347 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
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Ciao1Q99KN2 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ciao1Q99KN2 Inpp5j-201ENSMUST00000044507 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ciao1Q99KN2 Fam71e2-202ENSMUST00000174409 2716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ciao1Q99KN2 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ciao1Q99KN2 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ciao1Q99KN2 Fam234b-201ENSMUST00000111915 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ciao1Q99KN2 Ddr1-202ENSMUST00000097333 3593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ciao1Q99KN2 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ciao1Q99KN2 Gm42714-201ENSMUST00000202063 1364 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Ciao1Q99KN2 Gm45895-201ENSMUST00000212248 1697 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ciao1Q99KN2 Ptgr1-201ENSMUST00000030069 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ciao1Q99KN2 Ephb4-202ENSMUST00000111054 3784 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ciao1Q99KN2 Amz1-202ENSMUST00000120630 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ciao1Q99KN2 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ciao1Q99KN2 Zeb2os-201ENSMUST00000127150 1305 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ciao1Q99KN2 Tmem67-202ENSMUST00000108293 3945 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ciao1Q99KN2 Tial1-202ENSMUST00000106226 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ciao1Q99KN2 Scamp1-203ENSMUST00000152555 1877 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ciao1Q99KN2 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ciao1Q99KN2 Olfr1060-ps1-201ENSMUST00000118335 943 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Ciao1Q99KN2 Gm12420-201ENSMUST00000119869 1048 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Ciao1Q99KN2 6430531B16Rik-202ENSMUST00000121412 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ciao1Q99KN2 Gm12221-201ENSMUST00000125096 1131 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Ciao1Q99KN2 Gm11947-201ENSMUST00000125275 273 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ciao1Q99KN2 Gm12254-201ENSMUST00000134617 471 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Ciao1Q99KN2 Zfp961-204ENSMUST00000136516 601 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms