Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chd1P40201 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Chd1P40201 Pde6c-202ENSMUST00000112329 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chd1P40201 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chd1P40201 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chd1P40201 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chd1P40201 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chd1P40201 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chd1P40201 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chd1P40201 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chd1P40201 Gm12220-201ENSMUST00000118476 172 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Chd1P40201 B020031M17Rik-202ENSMUST00000180768 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chd1P40201 Mir7659-201ENSMUST00000184079 58 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Chd1P40201 Gm33263-201ENSMUST00000220371 459 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chd1P40201 Cbr1-201ENSMUST00000039659 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chd1P40201 Tsga8-201ENSMUST00000049420 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chd1P40201 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chd1P40201 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chd1P40201 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Chd1P40201 Gm37521-201ENSMUST00000193177 2045 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Chd1P40201 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chd1P40201 Sncaip-210ENSMUST00000179689 1512 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chd1P40201 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chd1P40201 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chd1P40201 Ciart-201ENSMUST00000036418 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chd1P40201 Gm21039-201ENSMUST00000223359 2012 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Chd1P40201 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chd1P40201 Gm13784-201ENSMUST00000119639 519 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Chd1P40201 Gm14439-201ENSMUST00000122320 441 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Chd1P40201 AC125223.1-201ENSMUST00000224004 749 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Chd1P40201 Gm6505-201ENSMUST00000094335 648 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Chd1P40201 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chd1P40201 Cdk5rap1-201ENSMUST00000028990 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chd1P40201 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Chd1P40201 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chd1P40201 Mospd1-201ENSMUST00000023836 1763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chd1P40201 Mospd1-202ENSMUST00000096447 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chd1P40201 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Chd1P40201 Rnase13-201ENSMUST00000089771 1412 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chd1P40201 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chd1P40201 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Chd1P40201 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chd1P40201 Gm34821-202ENSMUST00000209114 1949 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chd1P40201 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chd1P40201 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chd1P40201 Gm13498-201ENSMUST00000119159 2166 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Chd1P40201 Nox1-204ENSMUST00000159259 1581 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chd1P40201 Hmbox1-209ENSMUST00000176832 1586 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chd1P40201 Fgf9-203ENSMUST00000165526 3593 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chd1P40201 Igkv4-86-201ENSMUST00000103337 340 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chd1P40201 Wfdc11-201ENSMUST00000109332 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chd1P40201 Gm15050-201ENSMUST00000133723 552 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chd1P40201 Cgrrf1-203ENSMUST00000133989 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chd1P40201 1700028P15Rik-202ENSMUST00000139894 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chd1P40201 Gm11832-201ENSMUST00000148576 432 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chd1P40201 Ntpcr-208ENSMUST00000152189 822 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chd1P40201 Gm16337-201ENSMUST00000160368 917 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chd1P40201 Wfdc11-202ENSMUST00000167694 249 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chd1P40201 Gm22461-201ENSMUST00000175272 70 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Chd1P40201 6530403H02Rik-201ENSMUST00000182099 402 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chd1P40201 Gm9621-201ENSMUST00000183322 1003 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Chd1P40201 Nme6-206ENSMUST00000197627 905 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chd1P40201 Gm10577-201ENSMUST00000097954 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chd1P40201 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chd1P40201 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chd1P40201 Slc25a14-204ENSMUST00000134257 1805 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chd1P40201 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chd1P40201 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chd1P40201 Rims2-204ENSMUST00000226410 3685 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Chd1P40201 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chd1P40201 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chd1P40201 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chd1P40201 Drc3-203ENSMUST00000108722 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chd1P40201 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chd1P40201 AC160550.2-202ENSMUST00000227812 1861 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Chd1P40201 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chd1P40201 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chd1P40201 Gm21115-201ENSMUST00000187565 2578 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Chd1P40201 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chd1P40201 Dcpp3-201ENSMUST00000115428 610 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chd1P40201 Gm11223-201ENSMUST00000120560 450 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Chd1P40201 Gm25193-201ENSMUST00000176615 97 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Chd1P40201 Gm5857-201ENSMUST00000198953 493 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Chd1P40201 Gm42931-201ENSMUST00000201009 760 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chd1P40201 Gm44426-201ENSMUST00000204258 355 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Chd1P40201 AC102000.1-201ENSMUST00000226247 727 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Chd1P40201 AC119177.2-201ENSMUST00000226699 629 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Chd1P40201 Sag-201ENSMUST00000077772 1719 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chd1P40201 Gm15894-201ENSMUST00000162828 2067 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chd1P40201 Lztr1-202ENSMUST00000115681 3394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chd1P40201 Fcrl1-202ENSMUST00000163661 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chd1P40201 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chd1P40201 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chd1P40201 Ctss-202ENSMUST00000116304 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chd1P40201 Gm37389-201ENSMUST00000194885 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chd1P40201 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chd1P40201 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chd1P40201 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chd1P40201 Ccdc159-201ENSMUST00000006403 1531 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chd1P40201 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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