Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Cd300a-202ENSMUST00000106582 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Gm38336-201ENSMUST00000193040 2549 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Gm26912-201ENSMUST00000180988 1483 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Ctnnd1-214ENSMUST00000111688 6146 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Eif4e1b-201ENSMUST00000110003 2131 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Gm15264-201ENSMUST00000118050 502 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Gm28032-201ENSMUST00000184104 96 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 4930478P22Rik-202ENSMUST00000201921 723 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Gm31941-201ENSMUST00000209689 350 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Gm4763-201ENSMUST00000081657 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Wdr11-201ENSMUST00000084519 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 4732487G21Rik-201ENSMUST00000181495 2664 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Cnksr3-202ENSMUST00000150282 2554 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Gm14204-202ENSMUST00000123944 5380 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Ptpn5-202ENSMUST00000102626 3137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Gm42858-201ENSMUST00000202512 1704 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Adamts4-201ENSMUST00000111314 3761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Kcnj15-201ENSMUST00000037154 5089 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Akap8-201ENSMUST00000002699 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Gm38348-201ENSMUST00000191718 2273 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Cdyl-201ENSMUST00000075220 3470 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Gm28898-201ENSMUST00000189604 2167 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Aldoa-201ENSMUST00000032934 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Gm14540-201ENSMUST00000138298 3261 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 6030443J06Rik-203ENSMUST00000181764 4299 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Adgrf3-201ENSMUST00000088117 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Ebpl-201ENSMUST00000022494 10092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Tbc1d31-201ENSMUST00000022992 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Ncaph2-203ENSMUST00000088717 3302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Gabrb3-206ENSMUST00000196198 4348 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 4921507G05Rik-201ENSMUST00000181348 1653 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Umodl1-201ENSMUST00000066554 5007 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Zbtb37-205ENSMUST00000171748 2141 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Ntm-201ENSMUST00000075069 3022 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Cwc22-201ENSMUST00000065889 3471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Irx6-202ENSMUST00000167261 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Ccdc171-201ENSMUST00000053414 4525 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Gm31983-202ENSMUST00000210553 3155 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Gm28884-201ENSMUST00000190367 3994 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Papolg-202ENSMUST00000102863 2171 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Lnpk-203ENSMUST00000111993 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Mbd5-203ENSMUST00000112754 5978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Aldoart1-201ENSMUST00000078617 2052 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Olfr1410-202ENSMUST00000216553 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Nudt12os-201ENSMUST00000145848 939 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Ghrl-204ENSMUST00000203770 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms