Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 Gm18164-201ENSMUST00000213769 927 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Ciao1Q99KN2 Gm18166-201ENSMUST00000215557 927 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Ciao1Q99KN2 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ciao1Q99KN2 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ciao1Q99KN2 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ciao1Q99KN2 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ciao1Q99KN2 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ciao1Q99KN2 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ciao1Q99KN2 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ciao1Q99KN2 Llgl1-202ENSMUST00000108719 4268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ciao1Q99KN2 Zfp354a-204ENSMUST00000109122 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ciao1Q99KN2 Tnfaip8-212ENSMUST00000179937 2385 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ciao1Q99KN2 Atxn1l-202ENSMUST00000212605 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ciao1Q99KN2 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ciao1Q99KN2 Mkl1-204ENSMUST00000134469 4392 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ciao1Q99KN2 Gm14858-201ENSMUST00000138614 1758 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ciao1Q99KN2 Gm11427-201ENSMUST00000117952 1696 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Ciao1Q99KN2 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Ciao1Q99KN2 Rnf121-203ENSMUST00000106953 2545 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Ciao1Q99KN2 Scmh1-202ENSMUST00000064991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Ciao1Q99KN2 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ciao1Q99KN2 Pla2g2d-201ENSMUST00000030528 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Ciao1Q99KN2 Sh3glb1-204ENSMUST00000199531 2584 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Ciao1Q99KN2 Ampd2-203ENSMUST00000102638 3650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ciao1Q99KN2 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ciao1Q99KN2 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ciao1Q99KN2 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ciao1Q99KN2 B630019A10Rik-201ENSMUST00000149488 2407 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ciao1Q99KN2 Slfn1-201ENSMUST00000037994 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ciao1Q99KN2 Nampt-201ENSMUST00000020886 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ciao1Q99KN2 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ciao1Q99KN2 4933408B17Rik-201ENSMUST00000056932 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ciao1Q99KN2 Wdr25-201ENSMUST00000047115 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ciao1Q99KN2 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ciao1Q99KN2 Gm6755-201ENSMUST00000100598 864 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Ciao1Q99KN2 Gm6740-201ENSMUST00000100617 864 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Ciao1Q99KN2 Gm23604-201ENSMUST00000104311 132 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Ciao1Q99KN2 Gm12435-201ENSMUST00000118949 1016 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Ciao1Q99KN2 Gm13002-201ENSMUST00000119286 682 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Ciao1Q99KN2 Ak3l2-ps-201ENSMUST00000120282 672 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Ciao1Q99KN2 Gm14699-201ENSMUST00000122340 228 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Ciao1Q99KN2 Gm13554-201ENSMUST00000137349 477 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ciao1Q99KN2 Gm15472-201ENSMUST00000141652 847 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ciao1Q99KN2 Gm11521-201ENSMUST00000143302 329 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ciao1Q99KN2 Gm14174-201ENSMUST00000153158 161 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ciao1Q99KN2 Gm5561-201ENSMUST00000178932 480 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Ciao1Q99KN2 Gm3534-201ENSMUST00000182522 1001 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Ciao1Q99KN2 Gm5335-201ENSMUST00000182995 1000 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms