Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Trpc5-201ENSMUST00000040184 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp19Q3UJD6 2810471M01Rik-201ENSMUST00000146554 1597 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp19Q3UJD6 Dffa-201ENSMUST00000030816 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp19Q3UJD6 Gm11497-201ENSMUST00000138295 2154 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp19Q3UJD6 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp19Q3UJD6 Pdgfd-202ENSMUST00000168039 1795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Usp19Q3UJD6 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Usp19Q3UJD6 Ccdc33-204ENSMUST00000119665 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Usp19Q3UJD6 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Usp19Q3UJD6 Tmbim7-201ENSMUST00000014673 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Usp19Q3UJD6 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp19Q3UJD6 Armcx6-201ENSMUST00000052431 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp19Q3UJD6 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Usp19Q3UJD6 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Usp19Q3UJD6 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp19Q3UJD6 Mlc1-202ENSMUST00000109368 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp19Q3UJD6 Gpm6b-201ENSMUST00000060210 2858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp19Q3UJD6 Lrrc28-202ENSMUST00000053950 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Usp19Q3UJD6 AC156016.4-201ENSMUST00000227470 647 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
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