Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rps29P62274 5730596B20Rik-201ENSMUST00000070587 3354 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Gm17644-201ENSMUST00000181272 3200 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Zw10-201ENSMUST00000034803 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Gys1-206ENSMUST00000211150 2681 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Anxa11os-201ENSMUST00000184083 2479 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Olfr1349-207ENSMUST00000216447 2448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Htr3b-201ENSMUST00000008734 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Hcrtr2-203ENSMUST00000184757 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Gm32914-201ENSMUST00000203815 2228 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Rps29P62274 AC122293.1-201ENSMUST00000218333 2231 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rps29P62274 AC117245.3-201ENSMUST00000217495 2176 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Rps29P62274 2610301B20Rik-202ENSMUST00000101504 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Blnk-201ENSMUST00000054769 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Tmem92-201ENSMUST00000100554 2043 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Entpd8-202ENSMUST00000114376 1942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Mak16-201ENSMUST00000033983 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Adgrl3-204ENSMUST00000117407 5705 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Tbce-201ENSMUST00000039894 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Ifi211-201ENSMUST00000009340 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rps29P62274 1700110I01Rik-202ENSMUST00000112812 1737 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Lpxn-201ENSMUST00000025601 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rps29P62274 AC154640.1-203ENSMUST00000228316 1618 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Nrf1-203ENSMUST00000069831 1625 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Ppm1b-203ENSMUST00000112305 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rps29P62274 2810471M01Rik-201ENSMUST00000146554 1597 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Gm2721-201ENSMUST00000222380 1571 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rps29P62274 AC110091.2-201ENSMUST00000215107 1512 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Ptpn2-202ENSMUST00000120934 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rps29P62274 5031425E22Rik-202ENSMUST00000185943 1477 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Gm26632-201ENSMUST00000181120 1400 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Gm44975-201ENSMUST00000207435 1390 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Defb48-201ENSMUST00000100493 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Stmn3-201ENSMUST00000103045 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Gm24933-201ENSMUST00000103762 110 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Gm23252-201ENSMUST00000103776 110 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Gm22495-201ENSMUST00000104492 126 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Gm13171-201ENSMUST00000117233 391 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Gm6500-201ENSMUST00000119412 451 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Gm14213-201ENSMUST00000119778 768 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Gm13688-201ENSMUST00000121557 608 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Saxo2-202ENSMUST00000126478 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Gm12326-201ENSMUST00000132986 618 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Gm11513-201ENSMUST00000138855 751 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Tpi1-203ENSMUST00000149610 802 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Ubl5-203ENSMUST00000160124 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Gm26443-201ENSMUST00000179610 110 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Rps29P62274 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Gm8643-201ENSMUST00000195228 625 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Ighv1-2-201ENSMUST00000195325 378 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Gm37963-201ENSMUST00000195351 613 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Gm45469-201ENSMUST00000210468 854 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Gm34655-202ENSMUST00000215259 877 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Gm7594-201ENSMUST00000218595 871 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Gm2696-202ENSMUST00000220393 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rps29P62274 AC170597.1-201ENSMUST00000221956 440 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rps29P62274 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rps29P62274 AC133496.1-201ENSMUST00000223891 743 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Rps29P62274 CT030035.1-201ENSMUST00000223964 935 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Prss51-201ENSMUST00000063785 961 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Tas2r135-201ENSMUST00000070178 1093 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Vmn1r192-201ENSMUST00000072632 1067 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Gm10053-201ENSMUST00000073080 949 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Gm4883-201ENSMUST00000085702 528 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Olfr1513-201ENSMUST00000089739 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Mir483-201ENSMUST00000093631 73 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Srp14-201ENSMUST00000009693 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Mrgpra1-201ENSMUST00000098438 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Als2-201ENSMUST00000027178 6342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Ampd3-206ENSMUST00000170374 3489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Klhdc7a-201ENSMUST00000105031 7807 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Cfb-207ENSMUST00000176203 2733 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Cfb-201ENSMUST00000025229 2737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Gm37031-201ENSMUST00000195487 2530 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Gm37583-201ENSMUST00000195460 2487 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Ttll5-202ENSMUST00000040273 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Olfr30-202ENSMUST00000215691 2404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Trp63-207ENSMUST00000115308 2380 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Bsn-201ENSMUST00000035208 15938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Hsdl1-204ENSMUST00000212517 2215 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Gm44933-201ENSMUST00000208637 1987 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Gm26670-201ENSMUST00000180429 3287 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Ccdc87-201ENSMUST00000088653 3163 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rps29P62274 N4bp2l1-205ENSMUST00000202031 1864 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Gfm2-201ENSMUST00000022170 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Pik3r3-202ENSMUST00000106490 1830 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Gm32219-201ENSMUST00000221234 1819 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms