Protein–RNA interactions for Protein: P52194

Clgn, Calmegin, mousemouse

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Length 611 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClgnP52194 Zbtb8b-201ENSMUST00000053042 3288 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ClgnP52194 Cdh1-203ENSMUST00000167688 3203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
ClgnP52194 Park2-209ENSMUST00000191124 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ClgnP52194 Ccdc187-202ENSMUST00000217256 9411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
ClgnP52194 Specc1l-204ENSMUST00000218766 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ClgnP52194 Pygl-201ENSMUST00000071250 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ClgnP52194 Habp2-202ENSMUST00000095948 2815 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ClgnP52194 Dab2-202ENSMUST00000080880 4663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ClgnP52194 Ilf3-204ENSMUST00000213603 3430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
ClgnP52194 Myh10-201ENSMUST00000018887 7667 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
ClgnP52194 Suclg2-204ENSMUST00000204224 3367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ClgnP52194 Adam22-204ENSMUST00000088761 9077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ClgnP52194 Tardbp-210ENSMUST00000172073 6513 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
ClgnP52194 Krt34-201ENSMUST00000056362 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ClgnP52194 Kcnj5-202ENSMUST00000214223 3101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
ClgnP52194 Lsamp-201ENSMUST00000078873 2951 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ClgnP52194 Ttc1-201ENSMUST00000048578 1438 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ClgnP52194 Zmym6-201ENSMUST00000046751 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ClgnP52194 Gtf2ird1-206ENSMUST00000111244 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ClgnP52194 Mov10-207ENSMUST00000168015 3460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ClgnP52194 Mov10-201ENSMUST00000002297 3498 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
ClgnP52194 Adam20-201ENSMUST00000056331 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ClgnP52194 A330032B11Rik-201ENSMUST00000180609 1919 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ClgnP52194 Nrp2-206ENSMUST00000114157 6357 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ClgnP52194 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
ClgnP52194 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
ClgnP52194 0610040B10Rik-202ENSMUST00000162890 600 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
ClgnP52194 Gm21844-201ENSMUST00000178699 663 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
ClgnP52194 Olfr1432-201ENSMUST00000180978 930 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
ClgnP52194 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
ClgnP52194 Gm37638-201ENSMUST00000194337 1123 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
ClgnP52194 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
ClgnP52194 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
ClgnP52194 Fxyd1-214ENSMUST00000206328 545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
ClgnP52194 Gm45388-201ENSMUST00000209922 1132 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
ClgnP52194 Gm18035-201ENSMUST00000211962 589 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
ClgnP52194 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
ClgnP52194 Prss51-204ENSMUST00000224112 1042 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
ClgnP52194 AC164429.1-201ENSMUST00000224210 518 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
ClgnP52194 AC102847.1-202ENSMUST00000226313 1245 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
ClgnP52194 Gsto1-201ENSMUST00000026050 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ClgnP52194 Psmb7-201ENSMUST00000028083 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ClgnP52194 Eif4ebp3-201ENSMUST00000036765 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ClgnP52194 Fam3b-201ENSMUST00000049721 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ClgnP52194 AC165080.1-201ENSMUST00000215257 3123 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
ClgnP52194 Tomm20-201ENSMUST00000179857 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ClgnP52194 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ClgnP52194 AU022252-203ENSMUST00000141112 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ClgnP52194 Gad1-ps-201ENSMUST00000167243 1776 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
ClgnP52194 Rufy2-204ENSMUST00000131718 2816 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ClgnP52194 Celf1-203ENSMUST00000068747 7614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ClgnP52194 Nckap5-208ENSMUST00000161954 7090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ClgnP52194 Wdr60-201ENSMUST00000039349 3721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ClgnP52194 Slc16a5-202ENSMUST00000106532 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ClgnP52194 Eno4-202ENSMUST00000200910 2567 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
ClgnP52194 Eno4-201ENSMUST00000054280 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ClgnP52194 Gm7742-201ENSMUST00000167648 1527 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
ClgnP52194 Gm7732-201ENSMUST00000170486 1527 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
ClgnP52194 Gm7740-201ENSMUST00000186171 1527 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
ClgnP52194 Gm7736-201ENSMUST00000096981 1527 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
ClgnP52194 Havcr1-202ENSMUST00000081819 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ClgnP52194 Sgk2-202ENSMUST00000117123 3034 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ClgnP52194 Cct3-201ENSMUST00000001452 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ClgnP52194 Smarca1-202ENSMUST00000088973 4798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ClgnP52194 Exoc7-203ENSMUST00000106413 3298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
ClgnP52194 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ClgnP52194 Bcl2l11-202ENSMUST00000089634 2301 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ClgnP52194 Trib2-201ENSMUST00000020922 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ClgnP52194 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ClgnP52194 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ClgnP52194 Extl1-201ENSMUST00000030643 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ClgnP52194 Zmat2-201ENSMUST00000001419 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ClgnP52194 Rcbtb2-223ENSMUST00000170677 3573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ClgnP52194 Ifit1bl1-202ENSMUST00000168254 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
ClgnP52194 Gm43615-201ENSMUST00000197465 1773 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
ClgnP52194 Itgb8-201ENSMUST00000026360 8403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ClgnP52194 Gm11497-201ENSMUST00000138295 2154 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ClgnP52194 Gm26686-201ENSMUST00000181951 3467 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ClgnP52194 Dctn1-204ENSMUST00000113918 4321 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
ClgnP52194 Polq-202ENSMUST00000071452 7290 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ClgnP52194 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
ClgnP52194 Sfxn5-204ENSMUST00000113788 514 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ClgnP52194 Gm11380-201ENSMUST00000118067 560 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
ClgnP52194 Gm37988-201ENSMUST00000155020 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
ClgnP52194 Gm26119-201ENSMUST00000175601 104 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
ClgnP52194 Il12rb2-201ENSMUST00000018485 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ClgnP52194 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
ClgnP52194 Gm6352-201ENSMUST00000203583 1134 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
ClgnP52194 Gm45570-201ENSMUST00000211137 495 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
ClgnP52194 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
ClgnP52194 4930555K19Rik-201ENSMUST00000060066 171 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
ClgnP52194 Gad1-201ENSMUST00000094934 3355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ClgnP52194 C130083M11Rik-201ENSMUST00000197171 2072 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ClgnP52194 Erc2-205ENSMUST00000210135 6233 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ClgnP52194 Rps24-210ENSMUST00000225023 1613 ntAPPRIS P4 BASIC10.68□□□□□ -0.7
ClgnP52194 Gin1-203ENSMUST00000112844 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ClgnP52194 Myo15-202ENSMUST00000081823 7953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
ClgnP52194 AC108416.1-201ENSMUST00000228755 1558 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
ClgnP52194 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
ClgnP52194 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms