Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 5830411K02Rik-201ENSMUST00000200000 997 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Gm44304-201ENSMUST00000200509 145 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Gm3318-201ENSMUST00000217604 1183 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Gm3926-201ENSMUST00000223378 1123 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Fam198b-202ENSMUST00000118853 6729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Pax6-225ENSMUST00000167211 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 A330033J07Rik-201ENSMUST00000180921 2816 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Hmgb2-201ENSMUST00000067925 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Dpf2-202ENSMUST00000118623 2406 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Cnr2-202ENSMUST00000097843 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Rims2-204ENSMUST00000226410 3685 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Rere-202ENSMUST00000105682 7728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Ttpal-207ENSMUST00000171696 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Gm13120-201ENSMUST00000117343 1446 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Gm6783-201ENSMUST00000120916 1437 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Selenbp2-204ENSMUST00000173849 1323 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Gm4865-201ENSMUST00000196284 1309 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Trim36-202ENSMUST00000167364 4543 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Ap5z1-201ENSMUST00000038699 3689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Shank2-201ENSMUST00000097929 4418 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Gm28693-201ENSMUST00000189622 2638 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Nrap-202ENSMUST00000073536 5501 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Ppid-201ENSMUST00000029382 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 4930488L21Rik-202ENSMUST00000212638 3164 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Abca3-203ENSMUST00000117337 5202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Prom2-202ENSMUST00000103214 4190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Lonp2-207ENSMUST00000163987 1556 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 4933409D19Rik-201ENSMUST00000193674 1557 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Gm39117-201ENSMUST00000207692 1569 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Tmod1P49813 2410004P03Rik-201ENSMUST00000095823 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Fbln2-202ENSMUST00000113498 4644 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Ptpn2-202ENSMUST00000120934 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 5031425E22Rik-202ENSMUST00000185943 1477 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Gm45089-201ENSMUST00000208082 2040 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Anks1b-233ENSMUST00000183156 4248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Cln3-204ENSMUST00000116269 2487 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Atp9b-201ENSMUST00000091790 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Pxmp4-202ENSMUST00000109703 560 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Tmod1P49813 4930533B01Rik-201ENSMUST00000123377 1029 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Gng2-203ENSMUST00000159073 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Tmod1P49813 Fxyd5-210ENSMUST00000162116 817 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Cd79b-202ENSMUST00000167143 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 H2al1e-201ENSMUST00000178979 494 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Gm11942-201ENSMUST00000180255 345 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 H2al1b-201ENSMUST00000189531 495 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Gm45308-201ENSMUST00000210610 415 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Btg4-203ENSMUST00000213680 1282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Tmod1P49813 Bloc1s1-201ENSMUST00000026405 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Tmod1P49813 Tmem184a-202ENSMUST00000110832 4326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Tmod1P49813 Atp6v0a4-202ENSMUST00000114908 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 C130021I20Rik-201ENSMUST00000147294 3693 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Ccdc62-202ENSMUST00000165148 3920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Tmod1P49813 Specc1-214ENSMUST00000202389 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Tmod1P49813 Ppp1r17-201ENSMUST00000052827 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Smarca2-201ENSMUST00000025862 5921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Jmjd4-201ENSMUST00000045279 4315 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Nphs1-203ENSMUST00000126297 3877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Zc3hav1-201ENSMUST00000031850 3400 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Oxsm-201ENSMUST00000022311 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Tcl1b4-202ENSMUST00000222867 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmod1P49813 Mylk3-202ENSMUST00000121972 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmod1P49813 Dcaf11-206ENSMUST00000128490 2660 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmod1P49813 Mkrn1-ps1-201ENSMUST00000122035 1390 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmod1P49813 B430203G13Rik-201ENSMUST00000169657 1375 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmod1P49813 Zfand2a-201ENSMUST00000079996 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmod1P49813 Moxd2-201ENSMUST00000031937 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmod1P49813 Rps6-201ENSMUST00000102814 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmod1P49813 1700001C02Rik-202ENSMUST00000114743 729 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmod1P49813 Gm26368-201ENSMUST00000157826 118 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmod1P49813 Gm8705-201ENSMUST00000180823 812 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmod1P49813 Milr1-206ENSMUST00000182896 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmod1P49813 Milr1-207ENSMUST00000182908 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmod1P49813 Lockd-205ENSMUST00000185152 496 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmod1P49813 1700019D03Rik-207ENSMUST00000191441 638 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmod1P49813 Gm5543-201ENSMUST00000193329 1091 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmod1P49813 Gm4430-202ENSMUST00000193902 1041 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmod1P49813 Gm34868-201ENSMUST00000218341 530 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmod1P49813 CT025603.1-201ENSMUST00000224040 448 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmod1P49813 CT010505.2-201ENSMUST00000227918 998 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmod1P49813 Tsga8-201ENSMUST00000049420 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmod1P49813 Krtap2-4-201ENSMUST00000074926 828 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmod1P49813 Mrgpra1-201ENSMUST00000098438 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmod1P49813 Clcn6-205ENSMUST00000137724 5198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
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