Protein–RNA interactions for Protein: P17208

Pou4f1, POU domain, class 4, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f1P17208 Gm37362-201ENSMUST00000194567 634 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 Gm15469-201ENSMUST00000201750 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 Gm44420-201ENSMUST00000203669 490 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 Gm8255-201ENSMUST00000218693 305 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 Prss51-204ENSMUST00000224112 1042 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 Fam3b-201ENSMUST00000049721 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 Atp6v1e2-201ENSMUST00000065758 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 Vmn1r34-201ENSMUST00000074381 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 1700029P11Rik-201ENSMUST00000074608 1024 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 Krtap4-1-201ENSMUST00000081007 1015 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pou4f1P17208 Pde4d-209ENSMUST00000122041 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pou4f1P17208 Ppcdc-201ENSMUST00000085709 2744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pou4f1P17208 Trh-201ENSMUST00000006046 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pou4f1P17208 Rbm3-201ENSMUST00000040010 2792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pou4f1P17208 Gm7061-201ENSMUST00000118127 1416 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Pou4f1P17208 Stra6-213ENSMUST00000167479 2871 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pou4f1P17208 Smg7-202ENSMUST00000073441 5767 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pou4f1P17208 Gpr19-213ENSMUST00000215088 1484 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pou4f1P17208 Gm28042-202ENSMUST00000129685 4472 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pou4f1P17208 Npc1l1-201ENSMUST00000004505 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pou4f1P17208 Pax3-201ENSMUST00000004994 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pou4f1P17208 Smarca5-ps-201ENSMUST00000121843 3123 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Pou4f1P17208 Supt20-ps-201ENSMUST00000117999 1560 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Pou4f1P17208 Chrm5-201ENSMUST00000099589 1599 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pou4f1P17208 Ptpn7-201ENSMUST00000049449 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pou4f1P17208 Cx3cl1-201ENSMUST00000034230 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pou4f1P17208 Zfp42-201ENSMUST00000082120 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pou4f1P17208 5430434F05Rik-201ENSMUST00000206080 3553 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Pou4f1P17208 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Pou4f1P17208 Parp1-201ENSMUST00000027777 3873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pou4f1P17208 Atp10d-202ENSMUST00000126664 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pou4f1P17208 Slc16a5-202ENSMUST00000106532 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pou4f1P17208 Sema4d-203ENSMUST00000110040 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pou4f1P17208 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Pou4f1P17208 Slc7a3-202ENSMUST00000101362 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pou4f1P17208 Gm44699-201ENSMUST00000208229 5083 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pou4f1P17208 Agbl4-203ENSMUST00000106587 2631 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pou4f1P17208 Sptbn1-202ENSMUST00000011877 8238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pou4f1P17208 Papss1-206ENSMUST00000200527 2811 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pou4f1P17208 Aasdhppt-201ENSMUST00000051589 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pou4f1P17208 Tnc-204ENSMUST00000107377 7100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pou4f1P17208 Mid1-214ENSMUST00000163810 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pou4f1P17208 Pcdhga5-201ENSMUST00000193414 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pou4f1P17208 Adar-203ENSMUST00000107405 5871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pou4f1P17208 Aebp2-201ENSMUST00000032359 5932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pou4f1P17208 Akap1-203ENSMUST00000107904 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pou4f1P17208 Wfdc8-202ENSMUST00000109338 1794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pou4f1P17208 Slc12a6-204ENSMUST00000110991 4556 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pou4f1P17208 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pou4f1P17208 Gm14270-201ENSMUST00000118388 846 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Pou4f1P17208 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Pou4f1P17208 Klhl22-202ENSMUST00000120488 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pou4f1P17208 Wwtr1-202ENSMUST00000120977 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pou4f1P17208 Gm15031-201ENSMUST00000121341 210 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Pou4f1P17208 Gm12950-201ENSMUST00000121683 417 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Pou4f1P17208 Gm10169-201ENSMUST00000121822 348 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Pou4f1P17208 Gm14006-201ENSMUST00000122132 981 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Pou4f1P17208 Hectd2os-203ENSMUST00000142067 2662 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pou4f1P17208 Gm16263-201ENSMUST00000144680 502 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pou4f1P17208 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pou4f1P17208 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pou4f1P17208 Fcgr3-204ENSMUST00000169017 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pou4f1P17208 Plec-217ENSMUST00000169438 14827 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pou4f1P17208 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pou4f1P17208 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pou4f1P17208 Gm6358-202ENSMUST00000187643 489 ntAPPRIS P5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pou4f1P17208 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Pou4f1P17208 Gm4430-202ENSMUST00000193902 1041 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Pou4f1P17208 Gm8625-201ENSMUST00000194185 1077 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Pou4f1P17208 Gm38192-201ENSMUST00000194364 1847 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Pou4f1P17208 Gm10857-201ENSMUST00000195343 2794 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pou4f1P17208 Gm42974-201ENSMUST00000199556 2654 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Pou4f1P17208 Gm19566-201ENSMUST00000199576 610 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Pou4f1P17208 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Pou4f1P17208 Gm43377-201ENSMUST00000201640 455 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Pou4f1P17208 Zfp354a-201ENSMUST00000020628 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pou4f1P17208 Rp9-204ENSMUST00000216973 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pou4f1P17208 Gm5178-201ENSMUST00000219380 898 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Pou4f1P17208 Gm7441-201ENSMUST00000220697 1074 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Pou4f1P17208 AC165154.1-201ENSMUST00000226661 340 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Pou4f1P17208 Cntrl-201ENSMUST00000028235 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pou4f1P17208 Trim69-201ENSMUST00000036089 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pou4f1P17208 Tex45-201ENSMUST00000047265 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pou4f1P17208 Daam2-201ENSMUST00000057610 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pou4f1P17208 Xrcc6-201ENSMUST00000069530 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pou4f1P17208 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pou4f1P17208 Vipas39-202ENSMUST00000072744 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pou4f1P17208 Cyp4a12b-201ENSMUST00000094887 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pou4f1P17208 A1bg-201ENSMUST00000096418 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pou4f1P17208 Brca2-201ENSMUST00000044620 10724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pou4f1P17208 Myo1c-202ENSMUST00000102504 4659 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pou4f1P17208 Dhx30-219ENSMUST00000199529 4373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pou4f1P17208 Glyctk-201ENSMUST00000036382 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pou4f1P17208 Erich3-202ENSMUST00000098496 8280 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.1 ms